可以看出，蒙醫藥和中醫藥壹樣具有悠久的歷史，是蒙古族人民同疾病作鬥爭的經驗總結，並逐漸形成了蒙醫藥的獨特理論體系，積累了寶貴的臨床經驗。蒙藥作為蒙醫藥的組成部分又有“兩力、五元、六味、八性、藥性、藥能（效能）”等，這正是歷代蒙醫學家根據蒙醫藥理論體系所總結的用藥規律。
蒙藥和中藥雖然均為傳統醫藥，但是兩者在臨床用藥上卻不相同，很多蒙藥和中藥交叉使用，但有些藥作用機理卻不壹樣，如肉豆蔻，中醫用於溫中行氣、澀腸止瀉，而蒙醫用於治療心臟病；有些蒙藥材為中醫少用而蒙醫大量使用如石榴、黑冰片、大梔子、大蜀季花、山沈香、蒙古山蘿蔔等。蒙藥的炮制方法，炮制所用輔料，炮制程度也和中藥不同，而且蒙藥多為生用，服用方法和用量也各異。正因為如此，按蒙醫藥理論制成的蒙成藥，藥味濃、用量少（湯劑壹般口服壹次3~5克，丸、散劑口服壹次1.5~3克）、藥力大、作用獨特、療效突出。在長期醫療實踐中證明，蒙醫在治療偏癱、風濕、類風濕、心臟病、胃病、肺病、婦女病、偏正頭痛、咽喉痛等等都有壹些療效顯著的獨特方劑和蒙成藥，深受民族醫生和患者的歡迎和好評。
蒙藥工作，從70年代以來有了新的發展，國家很重視、關懷，醫藥的規範化工作，於1970~1972年普查內蒙古藥物資源的基礎上，編著出牌了蒙、漢文《內蒙古中草藥》二部。1972年~1977年較全面的調研、考證蒙藥材的基礎上，制定了部分蒙藥材、蒙成藥國家標準，蒙藥首次上了《中華人民***和國藥典》。接著內蒙古衛生廳組織編寫、制定《內蒙古蒙藥材標準》、《內蒙古蒙成藥標準》，近年經修訂後，頒布為《衛生部標準》。經自治區有關單位總結多年的臨床經驗，蒙醫臨床規範化研究的基礎上，通過了專家論證會後，於1997年國家中醫藥管理局頒布了《蒙醫內外婦兒科病癥診斷及療效標準》。同時，八省市自治區蒙醫藥新的壹代在茁壯成長，蒙醫醫療、教學、科研工作發展到壹個新的階段，蒙藥材的開發、蒙成藥的生產，蒙藥的研究工作都在蓬勃發展。當代，蒙醫藥已面向全國，走向世界，為世人所矚目，要為全人類更好的服務。