臨床醫學專業，中山大學的臨床醫學為醫學院的王牌專業，綜合實力居於國內知名醫學院校前列。中山大學醫學院是教育部、衛生部首批***建高校醫學院之壹。中山大學中山醫學院前身為創辦於1866年的博濟醫學堂、創辦於1908年的廣東光華醫學堂以及創辦於1909年的廣東公醫學堂，醫學專業教育功底紮實，師資力量雄厚。中山大學的臨床醫學、法醫學為國家級特色專業，專業優勢明顯。另外，中山大學的擁有七家附屬醫院，分別是中山大學附屬第壹醫院、第二醫院、第三醫院、第五醫院、第六醫院，中山大學中山眼科醫院、中山大學附屬腫瘤醫院。因此，中山大學臨床醫學的專業實踐平臺廣闊，專業學生的就業機會較多。
臨床醫學（八年制）：本博連讀。培養基礎紮實，人文素質好，能力強，發展後勁大，具有國際競爭力的高級臨床醫學專業人才。實施優生優培工程，全程配備優質導師，實行全程導學制度，全英文授課。整體課程依據全球醫學教育標準要求對醫學生提出的七大學習領域要求設計。畢業時授予醫學博士學位。本專業從2004年開始招生，是歷年高分考生的首選專業之壹。 臨床醫學專業（五年制）（國家特色專業、廣東省名牌專業）：培養從事臨床醫療工作的全科醫師，或在高校、研究機構從事教學、科研工作的高級人才。畢業生就業率高，就業面廣，培養的多數畢業生已成為各有關單位的教學、科研、管理部門的骨幹，受到各用人單位的普遍好評。開設的課程中大部分已經獲評國家級或省級精品課程，具有雄厚的師資力量。?
臨床醫學（眼科視光學方向，五年制）：中山大學眼科視光學系成立於1997年3月，是目前唯壹的壹個在重點高等醫學院校建立的眼科視光學本科教育機構，為國內視光學的發展、培養視光學專業人才、建立規範的視光學專業教育體制發揮著重要的作用。在眼科視光學領域的科學研究上，勇於走在國際、國內的前沿，在國內率先成立了臨床視光學、應用光學、隱形眼鏡、眼鏡工藝、低視力和雙眼視覺等專項研究室，利用現有資源開展了壹批視光學方面的科研項目。2001年建立的廣東省教育廳眼科視覺科學重點實驗室，開展了視覺科學和視功能檢測系列前沿的研究工作。至今已在國內外權威刊物上發表論文100多篇，其中SCI引用刊物10多篇；多次獲得國家級、省部級科技成果獎，2007年至今，本系已獲得了國家自然科學基金1項，省部級課題3項，廳局級課題2項，院系級課題1項，?211工程?重點學科建設基金1項及其他***20項的基金資助，資助總額達600多萬元。