山西中醫學院於1982年由國務院批準籌建。1986年，學校接收原山西醫學院中醫大學班；1989年6月，正式掛牌成立。2007年4月，學校以“良好”的成績通過了教育部本科教學工作水平評估。2008年2月，學校獲得碩士學位授予權。