口服核苷類似物藥物有六種：拉米夫定、阿德福韋酯、恩替卡韋、替比夫定、替諾福韋、丙酚替諾福韋，受到藥物可及性和價格因素的影響，應用恩替卡韋治療的乙肝患者最為廣泛。隨著丙酚替諾福韋的上市，它以高效抗病毒、副作用少、肝癌發生率低、至今保持零耐藥而備受青睞。註射幹擾素療法分為普通幹擾素和聚乙二醇幹擾素，普通幹擾素由於療效低、副作用多而逐漸被淘汰。聚乙二醇幹擾素盡管副作用多，但其療程短、轉陰率高仍被廣泛采納。