白塞病雖然少見，卻會引起嚴重後果。白塞病的初起癥狀如反復潰瘍，關節腫痛都容易被忽略或者誤診，最後未及時治療，導致全身性疾病。甚至導致失明，或死亡。
眼部病變是白塞病的典型表現，因為在所有白塞病患者中，絕大多數患者會出現眼部病變。眼部炎癥會因治療或自行緩解而減輕，但不能完全靜止。易反復發作，發作有壹定的周期性。每發作壹次，病情加重壹次。如果不能及時治愈，很容易導致失明。
白塞病屬於血管炎的壹種，所以它會累及全身血管，侵害到口腔、關節、眼睛、腸胃和神經等多個器官。由於白塞病易引起自身器官的免疫反應，使血管內皮細胞受損而發生血管炎或動脈瘤。出現血栓，使得血管腔狹窄，組織因缺氧而變性和功能下降，甚至壞死。肺部損害可因動脈瘤破裂出血及肺膿腫形成造成死亡。消化道損害可並發穿孔或出血，大多數病人在切除後易復發。
總而言之，白塞病雖然罕見，卻是壹種嚴重的疾病，如果不及時治療，會累及全身器官導致各個系統器官組織病變，嚴重的則有可能會導致死亡。所以如果出現口腔潰瘍反復發作，同時還伴有眼睛發炎，關節腫痛的癥狀的時候，應該立即到醫院進行檢查是否患上白塞病，以免延誤了診治的時機。