菏澤醫專在山東省算是比較好的醫學類專科學校了。主要體現在專升本率高，好就業，學校畢業生主要就業於醫療衛生單位、藥廠，就業質量高、穩定性強，社會認可度高。自2000年以來，專升本錄取人數和錄取率始終位居山東省同類院校前列。
學校現為全國健康養老服務生產性實訓基地、全國高等職業教育創新發展行動計劃單位、山東省優質高等職業院校建設單位，先後榮獲“山東省高等學校教學管理先進單位”“全省衛生科技教育工作先進集體”“省級文明單位”“平安校園”“省級園林式單位”“省級衛生先進單位”“省級社會治安綜合治理先進單位”“山東省大學生暑期社會實踐活動先進單位”“山東省就業創業工作先進集體”“山東省青年誌願服務先進集體”“菏澤市思想政治工作先進單位”“菏澤市花園式單位”“山東教育慈善獎先進單位”等榮譽稱號。