(二)編制和指導實施全市衛生發展規劃，制定管理措施，統籌和協調全市衛生資源配置，協調和指導實施區域衛生規範。負責市級衛生單位基本建設和下屬單位國有資產及全市衛生專項投資的監督管理。
(三)依據衛生法律法規，對傳染病防治和食品、職業、環境、學校、放射、公共場所、化妝品衛生和獻血進行監督管理。依法監督、管理和監督各級各類醫療衛生機構和衛生人員執法。普及衛生法律法規知識。負責衛生行政復議和衛生執法監督。
(四)研究制定醫學科技發展規劃，負責科研項目管理，組織技術開發和推廣應用。制定全市衛生行業在職教育培訓計劃並指導檢查實施。
(五)貫徹中西醫並重的方針，負責中西醫的繼承、創新和融合。研究提出中藥現代化規劃並監督實施。
(6)貫徹預防為主的方針，組織全民健康教育。對嚴重危害人民健康的疾病制定防治規劃並檢查監督實施。加強重大疾病的防治，包括傳染病、慢性非傳染性疾病、地方病、寄生蟲病和職業病。負責檢查、監督和指導全市愛國衛生工作。
(七)研究制定農村衛生、社區衛生服務、婦女兒童保健工作規劃和政策措施。指導基層衛生組織建設和初級衛生保健規劃的實施。
(八)制定醫療衛生服務質量標準和服務規範並組織實施，負責各級醫療機構的技術指導和組織醫療事故鑒定。
(九)研究制定全市衛生人才發展規劃。組織全市初級、中級衛生專業技術資格考試和高級衛生專業技術資格評審材料初審上報和衛生專業技術隊伍管理。開展衛生職業道德教育，加強行業精神文明建設。
(十)遇有重大突發事件和自然災害，組織調度全市各級衛生技術力量，組織搶救傷病員，實施重大突發事件和疾病的應急處理，預防和控制疫情和疾病的發生和蔓延。組織接收國內外捐贈的救災防病藥品、設備和資金。
(十壹)承擔愛國衛生運動委員會和市地方病防治領導小組的日常工作。
(十二)負責市衛生委員會確定的保健對象的保健工作。
(十三)承辦市政府交辦的其他工作。