日常調節
患者要適當休息，吃壹些少油、少肉、少渣、營養豐富、無刺激的清淡食物，保持心情愉快，多運動，做到勞逸結合。
系統療法
抗生素可根據病情口服、肌肉註射或靜脈註射。
“理氣舒腸方”治療；
慢性期，身體無力，主要是排出粘液。
慢性直腸炎急性發作時，清熱解毒，
潤腸通便。如果內急後重，排便頻繁者用知止導滯丸清理積物。
建議長期直腸炎患者或復發性直腸炎患者可采用中藥舒淇長方或EGF階梯免疫重組療法治療，同時註意飲食習慣。直腸炎主要是局部外用或保留灌腸，也可根據情況內服中藥。
局部治療
直腸黏膜水腫患者，可用生理鹽水、0.5-1%單寧酸、1: 5000高錳酸鉀溶液灌洗直腸。黏膜糜爛可以塗%醋酸可的松溶液或10%硝酸銀溶液。括約肌、肛提肌痙攣，可將溫熱的橄欖油註入直腸。若直腸黏膜萎縮幹燥，可每晚向直腸內註射0.5%薄荷油。臨床上用蜂蜜50-100毫升、香油50-100毫升、黃黴液50-100毫升隔日交替灌腸，每日兩次，療效較好。
使用藥劑
水楊酸偶氮磺胺類藥物:壹般首選柳氮磺胺吡啶(SASP)，適用於經腎上腺皮質激素治療緩解的輕或重患者，療效較好。
腎上腺糖皮質激素:適用於暴發性或重癥患者，可控制炎癥，抑制自身免疫過程，緩解中毒癥狀，療效較好。氫化可的松或地塞米松常用，每天靜脈滴註，7-10天。癥狀緩解後，口服潑尼松龍。病情控制後，減少劑量，停藥後可給予柳氮磺胺吡啶水楊酸鹽，避免復發。