1.不同的起源和傳承
道教醫生形成於古代。從道教到關公大德道，都是日常生活經驗的積累。道教醫學是以“道學”和《黃帝內經》為基礎理論，以陰陽五行學說為辨證手段，形神兼備而發展起來的“道學”學派。道醫是通過道教在宗教活動中對生命、健康、疾病的認識和理解，以及對長生不老的追求而形成的壹套帶有宗教色彩或民間文化性質的心身醫學體系。
而中醫則是在歷史發展過程中，以《黃帝內經》和陰陽五行學說為基礎。
2.醫療的目的不同
道醫的主要目的是凈化身心，回歸本真；幫助修行者更好的完成修煉成仙的過程。
中醫的目的更多的是幫助患者免除痛苦，享受生活。
3.學習醫學的不同方法
道醫的真傳秘傳很多，所學壹般會由壹位大師或玄學老師傳下來，內容不會隨便公開；
中醫可以從通俗的醫學書籍中學習和提高，壹般沒有深奧的部分。
4.不同的診斷和治療方法
中醫治療壹般是根據體質和器質性。如經絡、血氣、臟腑，都是看得見摸得著的物質。
道教醫生治療疾病將在形而上的本質和申遠的基礎上綜合考慮。在疾病的診斷中，除了存在外感內傷、情誌失調、飲食起居之外，還會考慮命運、鬼神、風水等原因。
(也就是說，要看患者發病的原因，是不是有壹個不好的時機，就註定了這場災難？是仇家債主來討債嗎？還是邪靈造成的？還是家宅陰宅風水不好造成的？這些都需要在具體的判斷過程中考慮。比如從風水學的角度來說，躺在房梁下的床上，會多夢，驚嚇，精神壓力大。在具體的治療方法上，除了針灸、煎藥、金石學、推拿、按摩，道醫還要考慮長生、驅邪、風水調理、魅惑等。)
5.治療的結果是不同的
道醫是道教在追求長生不老的過程中，以醫學和壹個修行者對生命、健康、疾病的認識來傳教的宗教活動。道醫通常具有壹定水平的特殊感知能力，所以往往能準確診斷，但不能直接告訴病人診斷方法；