首先，五運六氣被稱為中醫的最高境界。五運六氣出自黃帝內經，可以同時預測疾病的發生和氣候的變化，所以被稱為中醫的最高境界。五運六氣是通過自然氣候的規律影響人體健康和疾病變化的理論，也稱運氣學說。它是古人可以用肉眼觀察到的壹種天文現象，即以天幹地支作為計算手段，結合陰陽五行來確定不同的時間段，然後用來推斷人體在壹定氣候條件下的身心狀態。總的來說是結合天體、自然、人類生命規律的理論。但由於古人對世界的認識有限，所以五運六氣是以可觀測的天象為基礎的理論體系，是客觀與主觀並存的體系。
那麽，五運六氣就是指氣的五行運動和自然氣候的變化規律。五運是指五行的運行變化，即金木的水、火、土的運行變化。戰國時期的鄒衍最早提出五運，而六運是指風、寒、夏、濕、燥、火六種天氣變化，是天體運行引起的自然現象。中醫認為，天地之間的氣候變化必然作用於人和大地，從而引起不同的生理反應。因此，了解變化規律可以幫助我們預測疾病的發生和變化，從而達到預防和治療疾病的目的。所以五運六氣是中醫理論的基礎和核心。其次，五運六神結合了天文、地理、歷法、氣候、圖像等方面的研究成果。其應用範圍非常廣泛，不僅可以預測和治療疾病，還可以揭示自然氣候變化的規律，是承載著中華民族深厚哲學文化屬性的寶貴遺產。
最後，五運六氣在臨床應用上具有重要意義，但是不同的年份和季節運氣變化的特點不同，所以疾病的發病機理也會不同，所以五運六氣的應用也會隨著運氣的變化而變化。