二甲雙胍和阿卡波糖的降糖機制不同。
二甲雙胍主要通過抑制葡萄糖的來源和增加葡萄糖的途徑來降低血糖。
抑制葡萄糖的來源包括抑制肝糖原轉化為葡萄糖和減少腸道對葡萄糖的吸收。
增加葡萄糖的途徑是增加外周組織對葡萄糖的攝取和利用，即促進肌肉細胞和脂肪細胞對葡萄糖的攝取和利用，使多余的葡萄糖轉化為肌糖原和脂肪儲存，同時增加細胞的無氧糖酵解，促進葡萄糖的利用，從而降低血糖。
二甲雙胍不會增加胰島素分泌，不會導致正常人和二型糖尿病患者低血糖。可降低糖尿病患者的空腹血糖和餐後血糖。二甲雙胍還能降低血漿遊離脂肪酸和甘油三酯水平，減輕體重，抑制血小板聚集，恢復血小板功能，直接改善血管內皮功能，增加血流量，減少各種危險因素，從而保護心血管系統。
阿卡波糖主要通過競爭性抑制小腸上皮的α-葡萄糖苷酶，減少碳水化合物如澱粉、麥芽糖、蔗糖水解產生的葡萄糖，減少和延緩葡萄糖的吸收，從而降低餐後血糖。長期服用，可降低空腹血糖、尿糖，還可降低甘油三酯，減輕體重。
二甲雙胍和阿卡波糖有相似的適應癥。
二甲雙胍主要用於簡單飲食控制和體育鍛煉無效的輕中度二型糖尿病患者，尤其是肥胖的二型糖尿病。對於格列齊特、阿卡波糖和胰島素治療效果不滿意的二型糖尿病患者，二甲雙胍可以達到滿意的效果。二甲雙胍聯合“格列齊特XX”治療初診二型糖尿病優於單藥，二甲雙胍聯合格列齊特XX也可用於治療失敗的繼發性糖尿病患者。與胰島素聯合治療1型糖尿病或二型糖尿病可減少胰島素的用量。
阿卡波糖可單獨使用或與其他降糖藥聯合使用，特別適用於早期二型糖尿病的肥胖患者，主要表現為餐後高血糖，可延緩糖耐量受損向糖尿病的發展。通常與胰島素、格列齊特、二甲雙胍等降糖藥物聯合使用，治療單用效果差的患者，增強降糖效果，減少藥物用量，減少不良反應。
二甲雙胍和阿卡波糖哪個降血糖更快？
二甲雙胍口服後主要在小腸吸收，如鹽酸二甲雙胍片(格華止)。本品在國內的藥代動力學試驗表明，血藥濃度達峰時間為2小時，即2小時左右，降糖作用達到最大。如國內鹽酸二甲雙胍腸溶膠囊的藥代動力學試驗表明，血藥濃度達峰時間為2.7±0.5小時，即2.7小時左右，降糖作用達到最大。全部主要通過腎臟排泄，服藥24小時後90%通過腎臟排泄。
阿卡波糖幾乎不被人體吸收，主要在腸道發揮作用。服藥期間應增加飲食中碳水化合物的比例，限制單糖的攝入，如葡萄糖、果糖(水果中含量豐富)，以提高藥物療效。
阿卡波糖直接作用於腸道，只是減少和延緩葡萄糖的吸收，而二甲雙胍降血糖的方式很多，二甲雙胍降血糖的速度相對更快。