1，證書性質不同:衛生專業技術資格證書是衛生專業技術人員必備的資格，參加國家衛生專業技術資格考試，取得《衛生專業技術資格證書》，成績合格；中醫預防保健調理技術證書是由國家衛生委員會和中華中醫藥學會頒發的雙章證書。
2.針對不同人群:衛生專業技術資格證書面向醫療、預防、保健、藥學、護理等衛生技術專業人員；中醫預防保健調理技術證書針對的是從事健康行業的人，無論是開店的，比如養生館，理療中心，中醫中心，還是在醫院工作的醫生護士。