鼻咽癌病因學中最重要的因素之壹是愛潑斯坦-巴爾病毒(人類皰疹病毒)。臨床上已證實在鼻咽癌的活檢腫瘤細胞中檢測到愛潑斯坦-巴爾病毒的DNA和病毒抗原。大多數鼻咽癌患者的愛潑斯坦-巴爾病毒抗體濃度升高，該病毒與病變的改善或惡化呈正相關。鼻咽癌發生地區的聚集性反映了相同的地理環境和生活飲食習慣與鼻咽癌的發生有關。調查表明，鼻咽癌高發區的土壤、水和大米中的鎳含量高於其他地區，鼻咽癌患者頭發中的鎳含量也較高。高鎳含量的飲食可能是鼻咽癌發生的促進因素。此外，外周血淋巴細胞的家族性染色體畸變可能是鼻咽癌遺傳易感性的相關因素；吸煙、慢性炎癥、高鹽飲食、經常熬夜、經常壓力大、經常吃油炸、煙熏或腌制的食物，從而導致內分泌失調、機體功能紊亂、免疫力下降，也是導致癌癥的重要因素。
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