衛生院怕工商行政管理部門和衛生監督部門檢查。工商行政管理部門主要負責檢查健康中心的營業執照和經營行為。如果發現沒有營業執照，會被罰款，或者遇到證件審核困難。衛生監督部門主要負責檢查衛生院的衛生狀況和服務質量，如發現違法行為將依法依規處理。
公安機關和消防部門也可能對衛生院進行檢查，主要檢查衛生院的安全管理和消防設施。如果發現問題，健康中心可能會受到相應的處罰。