他在水火之言“五極皆極熱”的基礎上提到了水火、心腎的關系，水為靜而火動，靜則平，動則亂。“滋潤萬物的莫澤，在水之上”，所以火上若有水，則為“吉”，說明心清，四肢有力；火下不能生火，則“無益”，表現為心煩臉、腳熱；在心腎方面，心屬火，腎屬水，各種煩惱和傷害都是陽火引起的。壹水不能生五火，所以心火容易旺，腎水容易衰。所以治療應該是滋腎水治心火，也就是所謂的“清心安神”，也就是王太傅所說的“強水之主造陽”。
他獨特的“降心火，利腎水”的觀點，為溫病的治療開辟了新的途徑，所以後世醫家稱蘇皖為溫病學派的創始人，王倫在《明醫雜書》中說“熱用江河”也不無道理。朱震亨間接繼承了完整的素食學說，在“降心火，益腎水”的啟發下，因地制宜地提出了“陽常有余，陰常不足”的學說，被譽為“滋陰派”。