這類微生物以光為能源，二氧化碳為基本碳源，還有壹些被還原的無機化合物(水、硫化氫等。)作為氫供體來減少二氧化碳。它們的細胞都含有壹種或多種光合色素。
2.光能異養型
以光為能源，有機碳化合物(甲酸、乙酸、甲醇、異丙醇等)通過光合作用生長繁殖的微生物。)作為碳源和氫供體。
3、化學能自養型
以二氧化碳為碳源，利用銨、亞硝酸鹽、硫化氫、鐵離子等無機化合物氧化過程中釋放的能量生長的微生物。
4、化學能異養型
大多數微生物都屬於這種營養類型。他們使用有機碳化合物作為碳源和能源。
擴展數據:
微生物的生理代謝有很多種類型，是動植物無法企及的。
微生物具有許多獨特的代謝模式，如自養細菌的化學合成、厭氧生活、不釋氧的光合作用、生物固氮、復雜有機物的生物轉化、氰、酚、多氯聯苯等有毒物質的分解、對熱、冷、酸、堿、高滲、高壓、高輻射劑量等極端環境的耐受能力，以及病毒以無細胞形式存活的能力。
微生物產生的代謝產物種類繁多。只有壹種細菌，大腸桿菌，能產生2000-3000種不同的蛋白質。在天然抗生素中，2/3(4000多種)是由放線菌產生的。微生物產生的酶的種類也極其豐富。從各種微生物中，II型限制性內切酶只有1443種。