辦理食品安全許可證需要提交食品經營許可證申請書、營業執照復印件、食品安全制度管理文本、管理人員健康證明、公司選址平面圖、法人身份證復印件等相關材料，讓辦理食品衛生許可證的辦證人員進行審批。壹般做出決定後十天左右發放食品衛生許可證；
壹、食品安全許可證在食品藥品監督管理局網站辦理流程：
1、用戶登錄，打開瀏覽器，輸入相關登錄地址，如果已經有賬號的用戶，在普通登錄區輸入您註冊的用戶名、密碼，點擊 "登錄"！"按鈕。通過系統驗證登錄成功後，即可進入系統開展相關工作。
2、業務申請後，在首頁導航菜單中點擊 "證照申報"，首先會看到證照事項，按照從大類到小類的順序選擇需要上報審批的事項即可。
第壹步，點擊事項名稱填寫申請表。填寫完畢後，如果遇到多條業務線，可以通過右側的按鈕添加、刪除業務線。
第二步，填寫申報信息，系統顯示事項信息頁面，在此頁面中，上方會顯示申報事項名稱，頁面中間有三個選項 "辦事指南""填表"。表格下載"。頁面左上方為操作按鈕區，會看到三個按鈕 "暫存"、"提交"、"打印"。
第三步，打印申請表，企業用戶填寫完表格信息後，可以通過 "打印預覽 "來打印本次辦證所需的紙質申請表，系統會自動提取填寫的信息進行打印，打印出來的申請表可以補充完整、蓋章。
第四步，提交，企業用戶填寫完當前信息，確認無誤後，即可點擊 "提交 "按鈕，提交後，申請信息將上報藥監部門。此項業務申請操作完成。
二、《食品經營許可證》申辦須知：
1、申辦食品經營許可證，應當先取得《營業執照》等合法資質，從業人員健康證明。
2、申請人填寫申請書。申請表由申請人自行打印裝訂，認真閱讀填寫說明和附帶的申報材料，按照申請表的內容填寫。縣級以上人民政府食品安全監督管理部門沒收違法所得和違法生產經營的食品、食品添加劑，以及用於違法生產經營的工具、設備、原料等物品。
三、《食品經營許可證》辦理條件：
1、具有與經營食品品種、數量相適應的食品原料處理和食品加工、包裝、貯存等場所，保持該場所環境整潔，並與有毒、有害場所和其他汙染源保持規定的距離；
2、具有與經營食品品種、數量相適應的設備或者設施，具有相應的消毒、更衣、洗滌、采光、照明、通風、防腐、防塵、防蠅、防鼠、防蟲、洗滌以及處理廢水、存放垃圾和廢棄物的設備或者設施；
3、有食品安全專業技術人員、管理人員和保證食品安全的規章制度；
4、具有合理布局的設備和工藝流程；
4、具有合理布局的設備和工藝流程，防止待加工食品與直接接觸食品的原料和成品交叉汙染，避免食品接觸有毒物質、不潔物質；
5、法律、法規規定的其他條件。
食品在入市交易前，其食品生產者都要有相關的食品安全合格證，有了這個證才能進行生產，否則就是無證生產。而食品安全許可證是要到食品藥品監督管理局去申請辦理的。
法律依據：
《中華人民****、國家食品安全法》
第三十五條
國家對食品生產經營實行許可制度。從事食品生產、食品銷售、餐飲服務的，應當依法取得許可。但是，僅銷售食用農產品和銷售預包裝食品的，不需要取得許可。僅銷售預包裝食品的，應當報縣級以上地方人民政府食品安全監督管理部門備案。
縣級以上地方人民政府食品安全監督管理部門應當依照《中華人民****、國家行政許可法》的規定，對申請人提交的本法第三十三條第壹款第壹項至第四項要求的有關資料進行審查，必要時對申請人的生產經營場所進行現場核查；符合規定條件的，準予許可；不符合規定條件的，不予許可。
第壹百零九條
縣級以上人民政府食品安全監督管理部門根據食品安全風險監測、風險評估結果和食品安全狀況，確定監督管理的重點、方式和頻次，實施風險管理。
縣級以上地方人民政府組織本級食品安全監督管理、農業行政等部門制定本行政區域食品安全年度監督管理計劃，向社會公布並實施。
食品安全年度監督管理計劃應當將下列事項作為監督管理的重點：
（壹）針對嬰幼兒等特定人群的主輔食品；
（二）保健食品生產過程中的添加行為和按照技術要求組織生產的註冊或者備案情況，保健食品標簽、說明書以及宣傳材料上的功能宣傳情況；
（三）食品生產經營中發生食品安全事故風險較高的情況；
（四）食品安全風險監測結果表明可能存在食品安全隱患的情況。