醫療衛生事業關系到億萬人民的健康和千家萬戶的幸福，是重大的民生問題。深化醫藥衛生體制改革，加快醫療衛生事業發展，適應人民群眾日益增長的醫療衛生需求，不斷提高人民群眾健康素質，是落實科學發展觀、促進經濟社會全面協調可持續發展的必然要求，是維護社會公平正義、提高人民生活質量的重要舉措，是全面建設小康社會、構建社會主義和諧社會的重要任務。
新中國成立以來，特別是改革開放以來，我國醫療衛生事業取得了舉世矚目的成就。覆蓋城鄉的醫療衛生服務體系基本形成，疾病防控能力不斷增強，醫療保障覆蓋人口逐步擴大，衛生科技水平快速提升，人民健康水平顯著提高，居民主要健康指標居發展中國家前列。特別是抗擊非典取得重大勝利以來，各級政府加大投入，公共衛生、農村醫療和城市社區衛生發展加快，新型農村合作醫療和城鎮居民基本醫療保險取得突破性進展，為深化醫藥衛生體制改革奠定了良好基礎。同時也要看到，我國醫療衛生事業發展水平與人民健康需求和經濟社會協調發展要求之間的矛盾依然突出。城鄉、區域醫療衛生事業發展不平衡，資源配置不合理，公共衛生和農村、社區醫療衛生工作相對薄弱，醫療保障體系不健全，藥品生產流通秩序不規範，醫院管理體制和運行機制不健全，政府衛生投入不足，醫療費用上漲過快，個人負擔過重，人民群眾反映強烈。
當前是我國全面建設小康社會的關鍵時期，醫療衛生工作任重道遠。隨著經濟的發展和人民生活水平的提高，群眾對改善醫療衛生服務會有更高的要求。工業化、城市化、人口老齡化、疾病譜和生態環境的變化，都給醫療衛生工作帶來壹系列新的嚴峻挑戰。深化醫藥衛生體制改革是加快醫藥衛生事業發展的戰略選擇，是實現人民享受改革發展成果的重要途徑，是廣大人民群眾的迫切願望。
深化醫藥衛生體制改革是壹項涉及面廣、難度大的社會系統工程。我國人口眾多，人均收入水平低，城鄉、區域差距大，長期處於社會主義初級階段，這決定了深化醫藥衛生體制改革是壹項十分復雜艱巨的任務，是壹個漸進的過程。要通過長期的努力和不懈的探索，在明確方向和框架的基礎上，建立符合中國國情的醫藥衛生體制。因此，深化醫藥衛生體制改革，既要堅定決心，紮實推進，又要精心組織，穩步實施，確保改革順利進行，達到預期目標。