壹、在入境事務處官方網站列出的表格上填表預約；
二、按照預約時間攜帶證件到入境事務處填表；
三、按要求辦理銀行卡交費；
四、領取領證回執；
五、以領證回執上顯示的日期或領證日期後的日期為準，並在領證回執單上註明身份證。和收據。
補辦地點：
港澳通行證在內地遺失的，應及時攜帶居民身份證到派出所辦理掛失後再到出入境部門重新申請補辦，對於在旅途中遺失的通行證，可到當地相關旅行社咨詢辦理臨時通行證回內地。
在戶籍所在地：本人攜帶照片+照片回執到戶籍所在地公安局出入境管理部門辦理，可以網上預約。
不在戶籍地的：就業人員（國家在冊職工除外）需提供壹年及以上有效的本市居住證（即至少滿壹年）、自辦理當月起倒計時連續壹年的本市社保證明（斷繳、補繳不計）；高等院校在校學生需加持學校出具的證明和學生證。如果是登記備案的國家機關工作人員，要持申請回單位加蓋審批章。
報失程序：
內地居民到香港或澳門警方報失。如在澳門遺失，需憑報警回執向澳門治安警察局出入境事務廳申請掛失。
申領證件：
當事人憑香港警務處出具的遺失證件報警單或澳門治安警察局出入境事務廳出具的遺失證件通知書，向香港或澳門中國旅行社申領壹次性有效出入境通行證，並辦理以下手續：
當事人憑香港警務處出具的遺失證件報警單或澳門治安警察局出入境事務廳出具的遺失證件通知書，向香港或澳門中國旅行社申領壹次性有效出入境通行證，並辦理以下手續：
當事人應填寫出入境通行證申請表，並提交兩張近期正面免冠照片；
當事人應提供以下資料：
壹是提供身份證明材料。
如在香港辦理證件期間有可能逾期居留，當事人須向香港入境事務處辦理延期居留手續。
領取證件：
當事人憑收據按領取證件的時間到香港或澳門的中國旅行社領取壹次性有效回內地通行證。在香港領取證件後，當事人還需前往香港入境事務處辦理相關出境手續。
法律依據
《中華人民****、國家出境入境管理法》
第十條
來往於內地與香港特別行政區、澳門特別行政區之間的中國公民，來往於內地與臺灣地區之間的中國公民，應當依法辦理通行證，並遵守本法的有關規定。由國務院具體管理。
第十二條
中國公民有下列情形之壹的，不得出境：
（壹）未持有有效出入境證件或者拒絕、逃避邊防檢查的；
（二）被判處刑罰尚未執行完畢或者是刑事案件被告人、犯罪嫌疑人的；
（三）民事案件尚未審結，人民法院裁定不準出境的。(四）因擾亂國（邊）境管理秩序受過刑事處罰或者因非法出境、非法居留、非法就業被其他國家和地區遣返，尚未滿規定的不準出境期限的；
（五）可能危害國家安全和利益，國務院有關主管部門決定不準出境的；
（六）被判處刑罰尚未執行完畢或者是刑事案件被告人的；法律、行政法規規定不準出境的其他情形。