可以確定的是，藥物的配方和生產工藝可以申請發明專利，然後藥物的包裝可以申請外觀設計專利。以下是您可能想知道的申請藥品專利的流程。
首先，您需要整理藥品的藥物成分、制備方法和臨床效果等所有記錄。然後找壹家可靠的代理機構，簽訂保密協議，再把妳整理的材料交給代理機構進行檢索，初步評估是否可以申請（因為很可能其他文獻已經公開了這個配方，這種情況下，不建議再申請，會因為缺乏新穎性而被駁回，拿不到專利，白白花了申請費用）。
經過初審確定可以提出申請後，主體需要與代理機構簽訂代理合同，付款，然後代理機構根據檢索結果，調整專利的保護範圍，撰寫申請文件，期間需要與主體多次溝通，並將稿件反饋，最終主體確定後，代理機構將申請文件定稿，提交國家專利局、專利局進行審查。撰寫申請書是基礎，也是非常重要的，因為專利文件提交後，就不可能再增加新的內容，所以撰寫時要考慮全面，合理布局。
專利局對申請文件進行初步的形式審查和第二步的技術內容實質審查，壹般來說，委托代理機構做的專利申請，初步的形式審查都不成問題，個人申請的話就自己寫、可能因為不熟悉專利法及專利法的相關規定而無法通過初步形式審查導致專利被駁回，或者發出審查通知書而申請人不知如何答復而被視為撤回，導致專利被撤回。
實質審查是發明專利申請的重點，而實質審查中最常被指出的問題就是專利不具備創造性。
這個階段，審查員會針對專利技術的內容，檢索全球文獻（中外文都包括），看是否有與該專利相同或相近似的技術，如果發現有相近似的，就會發出審查意見通知書，指出內容已經公開，沒有新穎性或創造性，不能授權。這時候，就要考驗代理人的水平了（發明人沒有任何專利申請經驗，完全無法應對），代理人會分析審查員說的有沒有理由、有理由如何答辯、沒有理由如何答辯、是否修改申請文件、如何修改申請文件才能爭取最大的授權保護範圍等等。當然，這其中，對於技術問題的闡述還需要發明人的配合。來來回回這麽多個來回，如果審查員還是不認可，那只能收到駁回通知書，專利被駁回；如果最終審查員認可了專利技術的創造性，那麽恭喜妳，專利被授權了！此時，專利局會發出授權通知書，通知申請人辦理註冊手續並繳納年費，繳納年費後，經過壹段時間，專利局會頒發專利證書。整個申請過程就完全結束了。