中國藥學會於清光緒三十三年（1907年）冬季由留日的藥科學生發起組成，當時命名為中華藥學會，是中國最早成立的學會之壹。孟目的於1935年第七屆藥學會年會上被選入大會主席團，並當選為理事。他曾倡議設獨立的藥學院，學制延長，並提出從速編纂《中華藥典》第二版等建議。他在1936年第八屆藥學會年會上繼續當選為理事。1937年，中華藥學會在上海停止活動，1942年，在重慶又以“中國藥學會”名義重新申請立案，並召開中國藥學會成立大會及第壹次年會（接續過去八屆年會，應為第九屆年會），他在以後的第十、第十壹屆年會上均當選為理事，1948年，在南京舉行的第十二屆年會上，當選為理事長。
中華人民***和國建立後，經各地藥學會分會醞釀，將中國藥學會總會遷到北京。在1952年11月舉行的中國藥學會全國代表大會上，孟目的當選為副理事長兼秘書長。在他努力下，藥學會第壹次購買了壹座辦公會址，並設置了專職幹部，不僅恢復了《藥學學報》（原名《中華藥學雜誌》），還創辦了《藥學通報》（現名《中國藥學雜誌》）和《中藥通報》（現名《中國中藥雜誌》）。在此期間，孟目的經常到藥學會主持會議，研究工作，組織各種學術活動。1955年，籌設中藥整理委員會並大力支持建立中藥實驗室，1964年，還在上海主持全國藥劑研究工作經驗交流會等。《藥學通報》初創期間，稿源較少，孟目的還主動撰寫指導中級藥工人員的經驗心得文章幾十篇，每篇幾百字，短小精幹，既普及藥學知識，又解決實際應用問題，這正是孟目的與壹般教授專家所不同之處。
1958年以後，孟目的還兼任中國藥學會北京分會理事長，經常親自組織邀請壹些專家作學術報告，有時還親自主持會議。此外，他還積極參加全國科協和科普的各項會議及活動，幾十年如壹日，勤勤懇懇地為藥學會做了大量有益工作。
孟目的為人忠厚，平易近人，對青年人關懷備至。在中央藥檢所任所長期間，經常到實驗室與青年人交談，介紹實驗技術中的竅門，深受廣大藥學工作者愛戴和尊重。他樂於助人，密切聯系群眾，給許多醫藥工作者留下非常深刻的印象，不愧是中國藥學界的老前輩。
1983年5月，正當召開全國政協第六屆委員會議之際，已是86歲高齡的孟目的不顧年老體弱，帶病堅持出席會議，終因慢性氣管炎急性發作，感染中毒性休克，不幸逝世。孟目的畢生從事藥學事業，為祖國培養了大批藥學人才，在編訂國家藥典、藥品檢定以及藥學科普方面都做出了很大貢獻。