使用麻醉藥品阿片類藥物可引起內源性阿片肽系統的抑制，進而通過神經內分泌系統的壹系列復雜變化對機體造成損害，患者的身體狀況逐漸下降。內源性阿片肽系統受到抑制後，會導致下丘腦-垂體-腎上腺軸功能發生顯著變化[1]。首先，下丘腦促腎上腺皮質激素釋放激素（CRH）受到抑制，從而抑制了促腎上腺皮質激素的釋放，這壹結果又導致血液中促腎上腺皮質激素皮質醇的減少[2]。
（2）神經系統損害
濫用可卡因可導致壹定的神經系統癥狀，服用後其癥狀首先表現為精神異常，如煩躁不安、焦慮、激動、妄想、幻覺、興奮、抑郁甚至精神病等，精神癥狀多見於濫用可卡因的靜脈吸毒者。可導致嚴重精神障礙的藥物，如麥司卡林、苯環利定等，可導致中樞神經系統瞬間興奮狀態，但有時會陷入嚴重的抑郁狀態[3]；可引起焦慮、失眠、煩躁、瞳孔放大、體溫和血壓升高；對方向、距離、時間的感知出現偏差；最大的危害是判斷能力受損，導致暴力行為的發生。
（3）免疫系統損害
濫用藥物會對機體造成損害，導致免疫功能下降，據報道，靜脈註射海洛因成癮者外周血中免疫球蛋白較對照組明顯減少。壹項研究表明，阿片類藥物成癮者的膀胱癌發病率是單純吸煙者的 19 倍以上[4]。此外，吸毒成癮者極易並發各種病毒性肝炎、艾滋病、肺炎和肢體壞疽。許多專家指出，這些除了與使用不潔註射器有關外，還與吸毒者的免疫功能下降密切相關。
（4）對胎兒和新生兒的損害
許多毒品可以通過胎盤進入胎兒體內，因此，在懷孕期間濫用過阿片類、巴比妥類藥物、安定、苯丙胺等麻醉藥品和精神藥品的婦女的母親，其胎兒出生後也會出現戒斷綜合征，並可能早產，原因與子宮收縮有關。同樣的機制也會增加胎盤早剝的風險。對胎兒的損害主要是宮內發育遲緩和大腦發育不良，最常見的是嬰兒小頭畸形。臨床和實驗數據表明，接觸可卡因的嬰兒規律呼吸和喚醒能力受損，受損嬰兒易患嬰兒猝死綜合癥。
（5）對其他器官的損害
長期大量吸食大麻對肺部有嚴重的不良影響，可導致支氣管炎、支氣管哮喘、肺氣腫，甚至肺癌。吸入海洛因會導致肺部滑石樣病變，甚至死於急性哮喘。
（6）藥物依賴的醫源性損害
醫用麻醉劑主要指治療精神異常、劇烈疼痛或晚期癌痛的藥物。藥物依賴性是指患者長期使用這類藥物造成的，如醫生對抗焦慮藥如巴比妥類藥物、安定類藥物、鎮靜安眠藥等可產生依賴性認識不足，誤開、亂開導致的藥物依賴性。在醫療藥物濫用者中，醫護人員的藥物濫用率往往高於普通人群。
能夠被濫用的藥物被稱為毒品，對毒品產生依賴是造成毒品濫用的主要原因，但人類社會不可能完全禁絕毒品，這就是毒品的兩重性：壹是人們對毒品的認識有壹個過程。壹種毒品或化學物質，在人們還沒有認識到它的特殊毒副作用之前，它可能是壹種醫療用藥，但在認識到它的依賴性之後，通過相關法律程序就變成了違禁藥品；二是人類歷史上的許多毒品到現在仍在發揮作用，例如嗎啡等阿片類藥物具有很強的鎮痛作用，因而被廣泛應用於外科手術、腫瘤治療等。