根據上述職責，市外辦設11個內設機構：
（壹）綜合處（人事處）。
負責市委外事工作領導小組的日常工作；負責涉外地方政策法規的起草及全市外事、僑務、口岸的調研及涉外問題的研究工作；協調全市外事、僑務系統的工作，負責指導全市外事、僑務幹部培訓；負責協調或參與全市重大涉外活動；負責文電、會務、機要、檔案等機關日常運轉工作；承擔信息、安全、保密、信訪、政務公開、國有資產管理等工作；負責聘請“市長顧問”和授予“榮譽市民”稱號的承辦工作；負責編制和實施各類資金的使用計劃，對直屬單位的財務實施管理；負責辦機關和直屬單位的人事和機構編制管理工作；負責辦機關離退休幹部工作，指導直屬單位的離退休幹部工作。
（二）亞洲壹處。
負責協調、指導和處理我市與亞洲國家（不含朝鮮、韓國、獨聯體和西亞國家）之間的外事往來和有關事宜；負責我市與上述國家地方政府建立友好城市關系及在其他領域的交流與合作工作；辦理市領導人與上述國家的交往事宜；負責辦理上述國家駐華使館官員與我市的各項活動。
（三）亞洲二處。
負責協調、指導和處理我市與朝鮮、韓國、西亞國家之間的外事往來和有關事宜；負責我市與上述國家地方政府建立友好城市關系及在其他領域的交流與合作工作；辦理市領導人與上述國家的交往事宜；負責辦理上述國家駐華使館官員與我市的各項活動。
（四）歐洲非洲處。
負責協調、指導和處理我市與歐洲、非洲及獨聯體國家之間的外事往來和有關事宜；負責我市與上述國家地方政府建立友好城市關系及在其他領域的交流與合作工作；辦理市領導人與上述國家的交往事宜；負責辦理上述國家駐華使館官員與我市的各項活動。
（五）美洲大洋洲處。
負責協調、指導和處理我市與南北美洲、大洋洲國家之間的外事往來和有關事宜；負責我市與上述國家地方政府建立友好城市關系及在其他領域的交流與合作工作；辦理市領導人與上述國家的交往事宜；負責辦理上述國家駐華使館官員與我市的各項活動。
（六）出國審批管理處。
負責擬訂我市有關因公出國和赴港澳審批管理方面的規定；審核局級幹部因公出國和赴港澳事宜；審批因公出國和赴港澳團組工作；承辦跨地區團組任務件的確認；承辦外國和港澳人員來沈邀請事宜；指導出國人員教育工作；協同有關部門處理因公出國和赴港澳工作中出現的違紀事件。
（七）領事專家處。
負責協助上級業務部門對外國駐沈領事機構進行日常管理，處理我市涉領館的外事事項，統籌安排我市有關單位與外國駐沈領事機構的各類交往活動；負責協調處理在我市發生的各類涉外案件；會同有關部門協調在沈外國公民事務；負責協調和處理涉及我市駐外機構及公民的領事保護工作；負責境外非政府組織在我市活動及我市民間組織參加國際非政府組織活動的管理工作，擬訂相關的政策措施、管理規範並組織實施；負責協調有關部門處理我市涉及境外非政府組織的案（事）件；會同有關部門對我市聘請外國專家的學校和培訓機構進行資格審查和年檢工作。
（八）禮賓新聞處。
負責以市政府及市外辦（市僑辦）名義舉辦的大型國際活動的組織、協調工作，組織接待來我市訪問的重要外賓，統籌安排市領導人的外事活動；擬訂我市禮賓接待工作的規定並組織實施；負責指導重點參觀單位的外事接待和業務建設工作；組織編寫各種對外宣傳材料和開展有關對外宣傳活動；負責管理來我市采訪的外國記者和外國駐我市的新聞機構及常駐記者。
（九）口岸處。
負責沈陽口岸的綜合協調管理工作；協調督促口岸各查驗單位做好出入境檢查、檢驗、檢疫，以及外國人、港澳臺同胞落地簽證工作；負責協調、組織有關單位做好口岸的規劃、配套和基礎設施建設工作；負責我市重要代表團出訪和國外、港澳臺重要代表團及重要客人在沈陽口岸出入境的禮遇工作；負責我市大型活動及進出口商品博覽會通關協調工作；負責組織推進沈陽口岸“大通關”工作；組織、實施口岸系統的精神文明建設工作；負責協調開辟國際、國內航線工作，協調組織擬訂我市航線發展規劃及我市與航空公司開展戰略合作等相關事務；負責口岸業務的調研、總結、經驗交流及相關培訓工作；負責口岸綜合統計和分析工作；負責協調口岸單位之間的關系，協調解決有關口岸事務中的爭議問題。
（十）僑政處。
會同有關部門做好華僑和港澳同胞到我市定居工作；會同有關部門做好歸僑學生、歸僑子女、華僑在國內的子女升學工作；負責承辦華僑、華人和港澳同胞捐贈工作；配合有關部門做好歸僑、僑眷的救濟扶貧工作；負責僑務工作對象的身份認定和僑務信訪工作；負責協調、指導和處理涉及歸僑、僑眷的其他有關事宜。
（十壹）僑務（港澳）聯絡處。
負責與海外僑界重點人物及其僑團、商會的聯系，接待華僑、華人及港澳同胞，開展僑務考察宣慰、聯誼、招商引資、智力引進及文化交流活動；負責對我市僑資企業的認證和協調服務工作；通過僑務渠道開展對臺工作；負責我市與香港、澳門特別行政區的有關工作聯系；負責協調指導和處理涉及華僑、華人和港澳同胞的其他有關事宜。
機關黨委 負責辦機關和直屬單位的黨群工作。
紀檢組、監察處 合署辦公，負責紀檢和行政監察工作。