溫度變化也能使抗病品種變為感病品種，菠菜中有壹個抗CMV株系的品種，在16～23℃下根本不表現癥狀，病毒在植株體內也不增殖，但放在28℃下，該品種表現出高度感病，甚至在頂部出現壞死。抗病品種蠶豆 "Corbett Refugee "在 32 ℃ 以上的溫度下，幼苗在 4-5 d 後死亡。壹種抗病品種煙草，在溫度為16～20 ℃時抗病，侵染後無癥狀，當溫度升至22～28 ℃時，明顯發病，且體內病毒濃度隨溫度升高而增加。
溫度不僅影響植株的抗病性和病毒的增殖，還影響其潛伏期。例如，小麥矮縮病（北方花葉病毒）在23℃左右潛伏期為6～8d，但在秋末冬初接種該病毒後，隨著小麥休眠而將潛伏期延長至翌春小麥返青。卷心菜孤丁1號病毒（蘿蔔花葉病毒）在16℃為14～18d，而在最適溫度28℃為5～6d。
溫度也影響病害癥狀類型的變化。TMV 在普通煙草上，壹般在 20 ～ 30 ℃表現其典型癥狀。當溫度達到30℃時，典型癥狀逐漸消退，到36℃時，癥狀表現達到最低點，到36～37℃時，完全不表現癥狀或完全喪失其癥狀特性，以後即使溫度降低，也不能恢復其典型性。番茄斑萎病毒在20℃時表現為斑駁和皺縮癥狀，而在36℃時則以壞死為主，往往壹周內即可導致植株死亡。
不僅溫度對病毒的發生發展和癥狀表現有很大影響，土壤溫度對病毒病的表現也很突出，例如，大白菜種植在不同土壤恒溫槽中，用孤挺Ⅰ號病毒進行接種，結果感病品種隨土壤溫度升高而癥狀加重，病情加重。