根據相關藥品衛生標準並參照相關食品衛生標準，無公害中藥材的檢測應包括:中藥材中有毒物質的累積特征；有毒物質對外部環境條件和加工的穩定性；毒性物質在最敏感的慢性動物實驗中的最大安全閾值；根據人的體重和每日食物總量，計算出有害物質的最大攝入量。這些都是衡量健康食品和無公害中藥的基本標準。因此，如何達到這些質量標準，是GAP中藥生產中必須綜合考慮的問題。由於GAP無公害中藥是壹種衛生安全的藥品，食用無公害中藥無毒無害，能保證人體健康，維護良好的生態環境，所以提倡生產無公害、無汙染的“綠色藥品”。由於GAP中藥與普通中藥有嚴格的區別，在栽培技術和措施上也有不同的要求:壹是GAP無公害中藥生產基地的環境清潔，中藥產地的土壤、水質、空氣中所含的有毒物質必須控制在限量以下，以保證無公害中藥產品的持續生產；第二，GAP無公害中藥生產工藝嚴格，最大限度地使中藥產品無毒無害。比如提倡使用腐熟有機肥和生物肥，控制化肥用量，使用生態防治、生物防治、物理防治、人工除草等。防病、防蟲、防雜草，禁止使用高毒、高殘留農藥，限制使用壹般化學農藥，嚴格控制化肥用量；禁止用未經處理的汙水灌溉；無需人工合成植物生長調節劑，避免生產過程中有毒有害物質轉移到中藥產品中；
三是對GAP無公害中藥產品進行化學分析和定期檢測，產品符合衛生質量標準；並且在產品包裝、運輸、銷售過程中，也需要進行跟蹤檢測，防止中藥產品的二次汙染。下面緊緊圍繞這些方法和措施來談談如何建立無公害中藥材種植的GAP生產基地。
中藥生產基地的選擇應遵循中藥產地適宜的原則，因地制宜，合理布局，並註意“道地藥材”的地理和“產地”的概念。只有良好的生態環境才能生產出無公害中藥產品，這是無公害中藥的基礎。生產基地應選擇大氣、水質、土壤無汙染的區域，要求壹定範圍內無各種汙染源，灌溉水質應符合《農田灌溉水質標準》GB 5084-92；中藥炮制必須符合生產加工的水質標準；生產基地的大氣環境應符合《大氣環境質量指數》GB3095-82的二級標準；藥園土壤環境質量應符合土壤質量GB15618-1995二級標準。因此，中藥材GAP生產基地環境檢測的具體項目主要包括:農田灌溉水質指標，需要檢測pH、汞、鎘、鉛、砷、鉻、氟化物、氯化物、氰化物；除上述項目外，加工用水還應檢測細菌總數和大腸菌群；空氣質量指標需要檢測總懸浮顆粒物、二氧化硫、氮氧化物和氟化物；土壤質量指標主要檢測汞、鉛、鎘、鉻、砷、六六六、滴滴涕等殘留。
無公害中藥的GAP生產基地需要壹定的條件，也就是說不適合任何地區生產中藥。究其原因，壹方面，在特定條件下培育和生產中藥太難了；另壹方面，考慮到中藥材是高度商業化的經濟作物，中藥材基地的選擇必須考慮到中藥材產量和質量的提高，生產和消費的關系，以及國民經濟的發展水平。GAP中藥生產基地的總體要求可以從以下幾個方面考慮。