教育部重點實驗室:新安醫學教育部重點實驗室
安徽省重點實驗室:安徽省針灸基礎與技術重點實驗室、安徽省現代中醫藥重點實驗室、安徽省中醫藥研發重點實驗室。
安徽工程技術研究中心:安徽現代中藥工程技術研究中心
安徽省2011協同創新中心:安徽地道中藥質量提升協同創新中心。
國家中醫藥管理局中醫研究室(基地):現代中醫內科應用基礎與開發研究室、數字影像技術研究室、中醫研究室、神經生物學(針灸)研究室、免疫學研究室、細胞分子生物學(腦病)研究室、慢性阻塞性肺疾病肺氣虛證重點實驗室、國家中醫臨床研究基地2009-2014年，學校* * *承擔各級項目1，500余項，其中國家級項目1，36項 國家“863”計劃、星火計劃重點項目、重大新藥創制項目、國家自然科學基金和社會科學基金，且研究經費在2億元以上； 取得研究成果300余項，獲得科技獎勵27項(其中國家科技進步獎2項)。
在2015年度國家自然科學基金申請項目評審結果中，該校2015年度獲得項目23項，* * *批準直接資助經費947.9萬元(總經費約為11.85萬元)，超過了往年的資助額度。號國家自然科學基金資助項目負責人項目名稱項目類別1蛋白質中、高鐵氧化物的自制介晶血紅素電化學和光譜電化學研究青年科學基金項目2魚腥草素鈉抑制銅綠假單胞菌Las菌群感知與調控系統研究青年科學基金項目3謝冬梅基於競爭性抑制劑的蒼耳外來入侵對中藥蒼耳資源和化學品質影響的研究。青年科學基金項目4韓蘭研究桃紅四物湯對實驗性腦缺血血管生成的調節機制。青年科學基金項目5艾文龍肝豆片幹預肝豆狀核變性模型小鼠線粒體自噬機制的研究。青年科學基金項目6王潔瓊以單胺類為主。神經遞質慢性阻塞性肺疾病抑郁與“肺主悲”相關機制的研究:青年科學基金項目7，宗瑞凱基於FAK/鈣蛋白酶為中心的信號轉導網絡調節血小板活化，探討新風膠囊對再障大鼠的作用機制。青年科學基金項目8蔡興輝基於cAMP通路探討針刺幹預海洛因復吸大鼠成癮記憶的分子機制。青年科學基金項目9何路基於嗅覺通路探討艾煙對膝骨關節炎大鼠鎮痛作用的分子機制。10彭華生根據“器官特征-組織結構-化學成分”的相關性，揭示道地黃芪“辨證定質”的科學內涵。壹般項目11胡榮峰中藥局部釋藥膠囊型滲透泵控釋制劑的構建及釋放與吸收相關性研究。面上項目12陳基於/ MyD88/NF-kB受體信號通路和NALP3炎癥小體的粉萆薢皂苷治療痛風性關節炎的機制研究面上項目13徐釩基於腎病綜合征模型和NOS/ NO-AQP2通路項目當歸芍藥散的作用機制及物質基礎研究14王研究白頭翁湯正丁醇提取物對白色念珠菌臨床株形態轉化和生物膜形成的抑制作用及其作用機制項目15金玲基於Wnt信號通路調控胃癌細胞EMT的抗炎方藥， 胃癌侵襲轉移機制研究通用項目16方益氣活血法調控2型糖尿病內皮損傷大鼠血管新生通用項目17基於LKB1-AMPK自噬調節通路的通腑養髓方對高銅誘導多巴胺能神經元損傷的保護機制通用項目6543。8+08余慶健脾通利中藥對胃切除術後大鼠腸黏膜上皮緊密連接的影響及其機制壹般項目19李偉力補腎安泰顆粒改善RSA小鼠母胎界面血管生成障礙的機制研究壹般項目20蔡表黃埔通竅膠囊幹預Ca2+-CaMKIV信號通路及抑制AD治療中tau蛋白過度磷酸化的研究壹般項目21張清平探討白質超微結構改變在SIVD幹預中的作用壹般項目22吳子健HCN經針刺心經保護急性心肌缺血性心律失常大鼠心室功能的相對特異性研究。壹般項目23:王不留行艾灸調節mTOR信號通路抑制自噬的心肌保護作用。來源:館藏資源2010年6月，該校圖書館被國務院批準為“全國古籍重點保護單位”。
據2015年9月學校圖書館官網顯示，學校圖書館有中醫書庫、線裝書書庫、樣本書庫、外文書庫、中文二線書庫、專業期刊閱覽室、過期報紙閱覽室及其他閱覽室、電子閱覽室、自習室等26種書庫。此外，還建成了安徽首家古籍修復室；館藏各類紙質文獻89.9萬冊(其中教育部5萬冊)，訂閱中外紙質期刊1521種，擁有中國學術期刊全文數據庫、中國優秀碩士、博士學位論文全文數據庫、萬方數字期刊數據庫、萬方中國學位論文數據庫(博士學位論文)。有中國生物醫學文獻數據庫、中國藥學文摘數據庫、中國中醫藥數據庫、尹福在線考試數據庫、讀書秀學術搜索、NPC復制數據庫、萬方醫學視頻數據庫、ScienceDirect、Springer外文期刊全文數據庫、方泉外文期刊數據庫等27個中外數據庫。超星與中國數字圖書館、北大方正、書生之家、EBM等電子圖書* * * 80.2萬余冊，以及部分網上免費資源，電子資源容量已達65.6T .建立了壹系列服務器群，建立了較為完善的內部網絡信息服務平臺。《安徽中醫藥大學學報》(原名《安徽中醫學院學報》)是由安徽中醫藥大學主辦的中醫藥綜合性學術期刊，創辦於1981年65438+2月。該刊多次受到上級表彰獎勵:1989獲全省高校自然科學學報三等獎；1990獲全國高等醫學院校學報二等獎；1995獲全國高校優秀自然科學期刊三等獎、省級高校優秀自然科學期刊二等獎、省級高校優秀科技期刊三等獎；1998獲省優秀科技期刊二等獎；1999獲全國優秀高校自然科學學報三等獎、全省優秀高校學報壹等獎；2002年獲安徽省優秀科技期刊三等獎；2004年獲中國大學自然科學學報二等獎，安徽大學自然科學學報二等獎。2005年獲安徽省優秀科技期刊二等獎；2008年獲第二屆中國高校優秀科技期刊獎；2009年獲全國高校科技期刊優秀編輯質量獎，安徽省高校優秀期刊二等獎。2011本刊編輯部榮獲“中國高校科技期刊優秀團隊”稱號；2012獲第四屆中國高校優秀科技期刊獎；2013獲第二屆中國高校優秀科技期刊網站獎、安徽省優秀科技期刊獎。此外，該刊編輯多次受到教育部、衛生部、新聞出版總署、省科技廳、教育廳的表彰和獎勵。被中國科技信息研究所列為中國科技核心期刊(中國科技論文統計源期刊)，被中國學術期刊綜合評價數據庫(CAJCED)、中國期刊全文數據庫(CJFD)、中國核心期刊(精選)數據庫、中國生物醫學文獻服務系統(SinoMed)、美國化學文摘等數據庫收錄。