第壹類主要用於廄舍和用具的消毒藥，酚類、醛類、堿類、酸類、鹵素類、過氧化物類。具體如如石碳酸、煤酚皂溶液（來蘇兒）、克遼林（臭藥水）、升汞（二氯化汞）、甲醛溶液（福爾馬林）、氫氧化鈉、生石灰（氧化鈣）、漂白粉（含氯石灰）、過氧乙酸（過醋酸）等。
第二類為主要用於畜禽皮膚和黏膜的消毒防腐藥，醇類、表面活性劑、碘與碘化物、有機酸類、過氧化物類、染料類，具體如乙醇、碘、松餾油、水楊酸、硼酸、新潔爾滅、消毒凈、洗必泰等。
第三類為主要用於創傷的消毒防腐藥，如過氧化氫溶液、高錳酸鉀、甲紫、利凡諾等。 根據化學消毒劑對微生物的作用分類
（1）凝固蛋白質和溶解脂肪類的化學消毒藥：如甲醒、酚（石炭酸、甲酚及其衍生物——來蘇兒、克遼林）、醇、酸等。
（2）溶解蛋白質類的化學消毒藥：如氫氧化鈉、石灰等。
（3）氧化蛋白質類的化學消毒藥：如高錳酸鉀、過氧化氫、漂白粉、氯胺、碘、矽氟氫酸、過氧乙酸等。
（4）與細胞膜作用的陽離子表面活性消毒劑：如新潔爾滅、洗必泰等。
（5）對細胞發揮脫水作用的化學消毒劑：如甲醛液、乙醇等。
（6）與硫基作用的化學消毒劑：如重金屬鹽類（升汞、紅汞、硝酸銀、蛋白銀等）。
（7）與核酸作用的堿性染料：如龍膽紫（結晶紫）。還有其它類化學消毒劑，如戊二醛、環氧乙烷等。
以上各類化學消毒劑，雖各有其特點，但有的壹種消毒劑同時具有幾種藥理作用。 根據化學消毒藥的不同結構分類
（1）酚類消毒藥：如石炭酸等，能使菌體蛋白變性、凝固而呈現殺菌作用。
（2）醇類消毒藥：如70%乙醇等，能使菌體蛋白凝固和脫水，而且有溶脂的特點，能滲入細菌體內發揮殺菌作用。
（3）酸類消毒藥：如硼酸、鹽酸等，能抑制細菌細胞膜的通透性，影響細菌的物質代謝。乳酸可使菌體蛋白變性和水解。
（4）堿類消毒藥：堿類消毒藥如氫氧化鈉，能水解菌體蛋白和核蛋白，使細胞膜和酶受害而死亡。
（5）氧化劑：如過氧化氫、過氧乙酸等，壹遇有機物即釋放出初生態氧，破壞菌體蛋白和酶蛋白，呈現殺菌作用。
（6）鹵素類消毒劑：如漂白粉等容易滲入細菌細胞內，對原漿蛋白產生鹵化和氧化作用。
（7）重金屬類：如升汞等，能與菌體蛋白結合，使蛋白質變性、沈澱而產生殺菌作用。
（8）表面活性別：如新潔爾滅、洗必泰等：朗吸附於細胞表面，溶解脂質，改變細胞膜的通透性，使菌體內的酶和代謝中間產物流失。
（9）染料類：如甲紫、利凡諾等，能改變細菌的氧化還原電位，破壞正常的離子交換機能，抑制酶的活性。
（10）揮發性溶劑：如甲醛等，能與菌體蛋白和核酸的氨基、烷基、巰基發生烷基化反應，使蛋白質變性或核酸功能改變，呈現殺菌作用。