成本效益分析是衛生經濟學中分析投入（成本）和產出（效益）的壹種方法。
成本效益分析常用的評價指標有三個：時間性指標、價值性指標和效率性指標。
常用的藥物經濟學評價方法主要有四種：最低成本分析、成本效益分析、成本效益分析和成本效用分析。
核算成本分析：
XX年，醫院第壹季度支出比同期增加XX萬元，增長XX%，其中固定成本增長XX%，變動成本增長XX%。
電費成本為XX元，比同期減少XX元，減少XX%。從職工會計成本分析表可以看出，各核算部門電費成本均有所下降，說明各部門加強了電費成本的控制。
保健材料費支出XX元，比上年同期只增加XX元，增加XX%，大部分科室隨著業務量的增加而增加，但產科病人例數減少，萬元收入材料費比上年增加，希望科室負責人加強管理，控制成本，杜絕浪費。
洗滌用品支出XX元，比上年同期增加XX元，增長XX%，原因是：洗滌中心價格上漲；為保證醫療質量，消毒費用大大增加。
在藥物經濟學研究中，常用QALYs作為效用指標來量化健康結果，用QALYs作為項目健康產出的評價指標，將健康狀態下的生存時間與生存質量聯系起來。
評價方法，藥物經濟學評價旨在產生更經濟、更有效的結果。評價方法是衡量成本和效益、分析結果是否符合預期的手段。
目前，藥物經濟學研究中使用的評價方法有成本最小化分析法（CMA）、成本效益分析法（CEA）、成本效益分析法（CBA）和成本效用分析法（CUA）。
成本最小化分析（CMA）、成本效用分析（CUA）和其他方法，如預算影響分析（BIA）。
成本效用分析（CMA）是評估特定藥物或治療方法成本的最常用方法。如果兩種或兩種以上的治療藥物或方法具有幾乎相同的療效，那麽藥物經濟學評價多采用CMA，它只比較幹預方案的成本，成本最低的方案就是最優方案。
顧淑艷等[12]應用CMA對二甲雙胍和阿卡波糖治療2型糖尿病進行比較，發現在相同療效下，二甲雙胍方案最優，每年可節約治療費用約40%。Eric Quan Pang等[13]在對神經節囊腫切除術的研究中發現，關節鏡下神經節切除術的手術費用明顯高於開放性切除術，且手術費用明顯高於開放性切除術。費用明顯高於開放性切除術，且無優選性。
CMA有其局限性，只能用於比較治療效果相當的幹預方案。如果不能證明某種藥物或方法具有同等的治療效果，則不適合使用 CMA。例如，在臨床決策中，作為 "黃金標準 "的隨機對照試驗的結果是不可預測的，而且也不能確定比較的治療方法是否相同，因此不可能在進行隨機對照試驗的同時進行 CMA。簡而言之，人們並不期望采用 CMA 方法進行藥物經濟學評價。
雖然 CMA 是壹種不完整的分析方法，存在很大的局限性，但它與其他藥物經濟學評價方法壹樣，具有嚴謹的理論基礎。
成本效益分析是藥物經濟學評價中最基本的分析方法，其成本和產出均以貨幣計量。成本效益分析的評價指標是效益成本率（B/C），分子為治療的貨幣收益，分母為治療的貨幣投資。由於時間會對成本和收益的貨幣價值產生很大影響，因此在計算 B/C 時要考慮到幹預計劃實施的時間條件，這在經濟學中稱為貼現。
不考慮貼現：當評估計劃的時間少於 1 年時，采用成本效益分析法時不考慮貼現。在這種情況下，計算公式為：bt 為第 t 年年末的方案評估效益；Ct 為第 t 年的方案成本；n 為治療周期。貼現：在對超過 1 年的計劃進行評估時，必須對成本效益分析方法進行折現。在這種情況下，
在公式中，i 是貼現率，其余與上述相同。對於單個方案，如果 B/C 不小於 1，則表示所評估的方案具有經濟價值，可以采納；反之，則不具有經濟價值。在對多個幹預方案進行評估選擇時，需要考慮方案之間的關系。
成本效益分析旨在使用貨幣計量增量成本和效益，直接計算實現健康結果的凈貨幣成本，主要用於政府機構的健康政策制定。該方法可用於單壹幹預方案、壹種疾病的不同幹預方案以及不同疾病幹預方案的藥物經濟學評價。
例如，胡曉晗等人[14]從英國衛生系統進行研究，分析認為與傳統化療相比，PD-L1抑制劑Keytruda的定價過高，應用效果不佳。在韓國壹項基於真實世界數據的 CBA 應用研究中，從國民健康服務（NHS）的角度分析得出結論：與鈣基粘合劑產品相比，用於腎病透析患者血管鈣化的 Sevelamer 是醋酸鈣更具成本效益的替代品[15]。