本辦法所稱醫療機構，是指依法設立的從事疾病診斷、治療的診療機構。
計劃生育技術服務、疾病預防控制、保健等使用藥品的機構依照本辦法執行。第三條 市、區縣食品藥品監督管理部門負責本行政區域內醫療機構藥品的監督管理工作。
衛生、人口與計劃生育、物價、工商行政管理等部門應當按照各自職責，做好醫療機構藥品管理的相關工作。第四條 醫療機構應當建立健全藥品管理制度，保證藥品質量。第二章 藥品購進與儲存第五條 醫療機構應當從具有藥品生產、批發經營資格的單位購進藥品，購進沒有實施批準文號管理的中藥材除外。醫療機構購進藥品，應當由其內設的專門機構或者人員負責，其他內設機構和人員不得自行購進藥品。
醫療機構不得將藥品購進承包給個人。第六條 醫療機構購進藥品，應當驗明、核實供貨單位的藥品生產許可證或者經營許可證、營業執照、授權委托書等有效證明文件，妥善保存加蓋供貨單位印章的復印件，驗明藥品合格證明。不符合要求的，不得購進。
購進的藥品對運輸條件有特殊要求的，醫療機構應當查驗供貨單位的運輸條件是否符合要求。不符合要求的，應當拒絕接收。第七條 醫療機構購進藥品，應當建立真實、完整的藥品購進驗收記錄。驗收記錄應當載明下列內容：
（壹）生產企業、通用名稱、批準文號；
（二）劑型、規格、批號、生產日期、有效期；
（三）供貨單位；
（四）購貨數量、購進價格、購貨日期；
（五）驗收結論。
藥品購進驗收記錄保存時間不得少於三年。藥品有效期超過三年的，驗收記錄保存至藥品有效期滿後壹年。第八條 醫療機構應當按照藥品質量安全的規定分類存放藥品。
藥品與非藥品，內用藥與外用藥，中藥材、中藥飲片、危險性藥品、易串味的藥品與其他藥品應當分開存放。第九條 醫療機構應當根據診療科目和藥品使用範圍設置藥房或者藥櫃。設置的藥房或者藥櫃應當具備相應的設備、倉儲設施和衛生環境。第十條 醫療機構應當對儲存的藥品進行養護，采取相應的冷藏、避光、通風、防凍、防潮、防火、防蟲、防鼠等措施，防止藥品汙染、變質、失效。第十壹條 醫療機構應當將過期、失效、破損、黴變等不合格藥品集中存放於不合格藥品專庫（區），並將不合格藥品的品名、規格、批號、有效期、生產企業、數量、金額等情況，每季度末向食品藥品監督管理部門和衛生行政部門報告，由食品藥品監督管理部門監督銷毀。第三章 藥品調配與使用第十二條 醫療機構使用藥品，應當明示藥品的價格，配備具有法定資格的藥學技術人員；其他使用藥品的機構應當配備經市食品藥品監督管理部門考核合格的藥學技術人員。第十三條 醫療機構的執業醫師、執業助理醫師和鄉村醫生應當根據患者的病情，遵循用藥規範，開具所需種類、劑量和數量的藥品；所開處方或者藥方應當使用藥品的通用名稱並書寫規範。
患者或者其家屬有權知悉處方或者藥方所列藥品的預防、診斷、治療的作用、毒副作用、價格情況，有權選擇治療效果相同或者相近的藥品。執業醫師、執業助理醫師和鄉村醫生有告知的義務，並應當尊重患者或者其家屬的權利。第十四條 醫療機構應當按照處方、藥方或者醫囑調配和使用藥品。
醫療機構的藥劑人員調配處方或者藥方應當進行核對，不得擅自更改或者代用處方或者藥方所列藥品。對有配伍禁忌或者超劑量的處方或者藥方，應當拒絕調配；必要時，應當經處方醫師或者藥方醫生更正或者重新簽字，方可調配。第十五條 醫療機構的藥劑人員調配藥品需要對最小包裝拆零的，應當做好拆零記錄，並保留原最小包裝物。拆零後的藥品包裝物表面，應當註明藥品名稱、規格、用法、用量、批號、有效期等內容。第十六條 醫療機構調配藥品的場所、設施、包裝材料等，應當符合衛生和質量安全要求，不得對藥品產生汙染，影響藥品質量。