便攜式質譜儀是新型質譜儀的研究熱點之壹，便攜式質譜儀的研究主要集中在電離技術和質量分析技術上，檢測器多采用德泰公司和SGE公司的商品化檢測器。為適應電離技術、質量分析技術的飛速發展，發展高性能離子檢測技術已迫在眉睫，低噪聲、高穩定性、寬質量範圍、較低的質量鑒別、長壽命、低成本將是離子檢測技術發展追求的目標。
質譜與光譜、核磁**** 振蕩等方法是並列關系，暫時還很少有交叉領域。事實上，質譜與這些經典光譜方法的交叉也是壹個值得重視的研究領域。
生物質譜法可提供快速、易解的多組分分析方法，並具有靈敏度高、選擇性好、準確度高等特點，其應用範圍遠遠超過了放射免疫分析和化學檢測的範圍，生物質譜法在醫學檢驗中可用於生物體內，主要進行組分序列分析、結構分析、分子量測定和各組分含量測定等。1.核酸檢測的應用：核酸的分子生物學研究已成為生命化學、分子生物學和醫學領域最具活力的研究方向之壹。通過現代生物質譜技術，我們不僅可以獲得寡核苷酸的分子質量，還可以通過相關技術獲得其序列信息。2.小分子生物標誌物檢測的應用：質譜技術在檢驗醫學中的應用較早也較廣泛，通過核素稀釋 GC-MS 分析小分子生物標誌物，是許多生物小分子檢測的參考方法，主要分析項目有氨基酸、脂肪酸、有機酸及其衍生物、單糖、前列腺素、甲狀腺素、膽汁酸、膽固醇和類固醇、生物胺、脂類、碳水化合物、維生素、微量元素等。,其中不乏更為復雜的方法，如激素檢測和利用串聯質譜法進行新生兒氨基酸、遊離肉堿和酰基肉堿的篩查系統，美國食品藥品管理局（FDA）於 2004 年 2 月 24 日還專門制定了《利用串聯質譜法分析新生兒氨基酸、遊離肉堿和酰基肉堿》。美國食品和藥物管理局（FDA）還制定了 "串聯質譜法用於新生兒篩查測試系統氨基酸、遊離肉堿和酰基肉堿分析 "的指導文件。生物質譜法作為臨床檢測中可追溯性的參考方法，也發揮著重要作用。由於質譜法在測量的準確性和可靠性方面具有很大的優勢，許多國際組織或校準物生產商都采用質譜法作為參考方法，對壹些測量項目如葡萄糖、尿酸、T4、肌酐等設定校準物值。3.大分子生物標誌物檢測的應用：大分子生物標誌物按其結構可分為蛋白質、糖蛋白和寡核苷酸。蛋白質是疾病的重要生物標誌物。當異常基因產生異常蛋白質時，臨床實驗室可測量代謝物濃度、代謝組變化，並檢測與疾病相關的異常功能蛋白、結構蛋白或蛋白指紋，為診斷疾病提供數據。代謝組、蛋白質組和基因組分析之間的相互作用將是未來幾年發展的主要挑戰和機遇。臨床檢驗將按順序進行這些分析，首先確定與疾病相關的代謝組，然後通過蛋白質和/或 DNA 分析驗證確定的代謝組，最後與其他臨床信息和實驗室數據壹起確定疾病的嚴重程度並制定治療策略。腫瘤標誌物的測定是生物質譜臨床檢測應用中最突出、最有價值的領域，生物質譜在腫瘤早期檢測方面最有前景。根據生物質光譜技術對乳腺癌等l2種腫瘤的血清和尿液檢測結果證實，其檢測靈敏度為82%～99%；診斷特異性為85%～99%，結果令人震驚。4.微生物鑒定的應用：通過生物質譜技術可獲得每個細菌分離物獨特的肽模式，根據每個細菌的肽模式或指紋圖譜來鑒定細菌，Hsu 曾用串聯質譜技術鑒定沙門氏菌。由於細菌體內蛋白質含量較高，生物質譜法通常可用於鑒定細菌的屬、種和菌株；串聯質譜法還可用於鑒定糖類或脂類的脂肪酸組成；此外，通過對生物樣本的處理，串聯質譜還可用於從單個細菌的水平發現和確定病原體和孢子的水平；通過對特殊脂質成分的分析，可了解樣本中病原菌的存活能力和感染的可能性。5.藥物分析的應用：質譜在藥物分析中的應用包括：合成藥物成分分析、天然藥物成分分析、多肽和蛋白質藥物（包括糖蛋白）氨基酸序列分析、藥物代謝研究和中藥成分分析等。實驗室醫學中更常見的應用是治療藥物監測（TDM）。以前，藥物檢測主要使用免疫化學技術和高效液相色譜法（HPLC）。免疫化學技術雖然簡單易用，但檢測的藥物種類相對較少。高效液相色譜法（HPLC）的藥物種類較多，但表征的可靠性較差。然而，液相色譜-質譜聯用（LC．MS）是壹種準確、快速的藥物檢測技術，幾乎可用於所有藥物的檢測，如抗癌藥物、免疫抑制劑、抗生素和心血管藥物等，有望成為藥物檢測的最有力工具。