漢朝《神農本草經》記載：“菊花久服能輕身延年”。《西京雜記》：“菊花舒時，並采莖葉，雜黍米釀之，至來年九月九日始熟，就飲焉，故謂之菊花酒”。“當時帝宮後妃皆稱之為“長壽酒”，把它當作滋補藥品，相互饋贈。這種習俗壹直流行到三國時代。“蜀人多種菊，以苗可入萊，花可入藥，園圃悉植之，郊野火采野菊供藥肆”。從這些記載看來，中國栽培菊花最初是以食用和藥用為目的的。
晉朝陶淵明（355-417年）愛菊成癖，曾廣為為流傳。他寫過不少詠菊詩句，如“采菊東籬下，悠然見南山”；“秋菊有佳色，更露攝其英”等名句，至今仍燴炙人口。當時上大夫慕其高風亮節，亦多種菊自賞，並誇贊菊花是“芳熏百草，色艷群英”。
南北朝的陶弘景（452-536年）將菊花分為“真菊”和“苦薏”兩種。莖紫、氣香而味甘，葉可作羹食者為真菊；青紫而大，作蒿艾氣，味苦不堪食者名苦薏，非真菊也。這對菊花的認識又進了壹步。
唐朝（618-907年）菊花的栽培已很普遍，栽培技術也進壹步提高，采用嫁接法繁殖菊花；並且出現了紫色和白色的品種。如李商隱詩：“暗暗淡淡紫，融融冶治黃”。白居易詩：“滿園花菊郁金黃，中有孤叢色似霜”等就是明證。這時，菊花從中國傳到日本，得到日本人民的贊賞。之後他們將菊花與日本若幹野菊進行雜交，而形成了日本栽培菊系統。
宋朝栽培菊花更盛，隨著培養及選擇技術的提高，菊花品種也大量增加，這是從藥用而轉為園林觀賞的重要時期。在此期間的菊譜，對所栽的品種即以花色歸類，並對花形也有較詳細的記載。劉蒙的《菊譜》（1104年）是最早記載觀賞菊花的壹本專著，記有菊花品種26個。範成大菊譜（1018）記載有35個品種，其中的“合蟬”、“紅二色”是管瓣出現的最早記載。其後，花色又出現了綠色的“綠芙蓉”和黑色的“墨菊”。在栽培上對菊花的整形摘心、養護管理和利用種子繁殖獲得新品種等都有了進壹步的經驗。《致富廣集五記》記載：“臨安園子，每至重九，各出奇花比勝，謂之開菊會”。《杭州府誌》中記載：“臨安有花市，菊花時制為花塔”。可見南宋時的首都臨安有了花市、花會。流傳至今的菊花會是在南宋時杭州開始的。宋未史鑄的《百菊集譜》記載有131個菊花品種。
明朝栽菊技術又進壹步提高，菊花品種又有所增加，菊譜也多了起來。如黃省曾、馬伯州、周履臣、高濂、樂休園等人都著，有《菊話》。在黃省曾的《菊譜》中記載了220個菊花品種。李時珍的《本草綱目》（1580年）和王象晉的《群芳譜》（1630年）對菊花都有較多記載。《群芳譜》對菊花品種作了綜合性研究，記有黃色92個品種，白色73個品種，紫色32個品種，紅色35個品種，粉紅22個品種，異品17個品種，***6類、271個品種；至少有16種花型。
清朝的菊花專著更多，有陳昊子《花鏡》、劉灝《廣群芳譜》、許兆熊《東籬中正》、陸延燦《藝菊誌》、閩延楷《養菊法》、徐京《藝菊簡易》、顏祿《藝菊須知》、計楠《菊說》、陳謀善《藝菊瑣言》、吳儀壹《徐園秋花譜》等等。《花鏡》壹書記載當時菊花有黃色的54種，白色的32種，紅色的41種，紫色27種，***計154個品種。計楠的《菊說》載有菊花品種233個，其中新培育的品種有100多個，並提出了菊花育種的方法。清朝菊花品種日益增多，在乾隆年間還有人向清帝獻各色奇菊，乾隆曾召集當時花卉畫家鄒壹註進宮作畫，並裝訂成冊。在文人中畫菊題詩，也蔚然成風。中國菊花傳入歐洲，約在明未清初開始，1688年荷蘭商人從中國引種菊花到歐洲栽培，1689年荷蘭作家白裏尼曾有《偉大的東方名花——菊花》壹書。18世紀中葉，法國路易·比爾塔又將中國的大花菊花品種帶到法國。19世紀英國植物學家福窮（Fortune）曾先後在中國浙江省舟山群島和日本引入菊種，並進行雜交育種，而形成英國菊花各色類型。不久，又由英國傳至美國。從此，這壹名花遍植於世界各地。中國的栽培菊花也就成為今天西洋菊花的重要親本。
民國以來，菊花品種大批失散，已無正式文獻可查。解放後，隨著園藝事業的發展，菊花也經歷了曲折歷程而日益發展壯大。菊花的栽培歷史，是中國花卉園藝發展的壹部分。近年來，在繼承前人經驗的基礎上，提高栽培技術，采用雜交育種、輻射誘變、組織培養等新技術，不僅提高了菊花的生產質量，並使品種數量劇增，據不完全統計已經達7000個品種以上。大立菊壹株可開花5000朵以上，案頭菊、盆景菊的發展。