另外，防衛廳也升格為國防部。
內閣官房：（日語：ないかくかんぼう；英語：Cabinet Secretariat）相當於我國的中央秘書處、辦公廳、國務院辦公廳的綜合職能，但權限更大。內閣官房是日本內閣的行政機關，負責組織內閣會議事務、內閣事務，並對各部門的行政進行總體調整。內閣官房長官兼任國務大臣，是首相的得力助手，經常參與首相的組閣過程。
國家公安部：相當於我國的公安部。警察局應該只是不屬於該委員會的壹個部門。
內務省（そうむしょう、Ministry of Internal Affairs and Communications） 主要管理行政組織、公務員制度、地方政府財政、選舉制度、信息通信、郵政、統計等。它還負責政府的行政管理。
衛生、勞動和福利部（MHLW）：厚生省是日本負責醫療和社會保障的主要部門，下設 11 個局，主要負責日本的國民健康、健康保險、醫療服務提供、醫藥和食品安全、社會保險和社會保障、勞動就業、弱勢群體社會援助等事務。以及衛生領域的7個部門，涵蓋了我國衛生部、食品藥品監督管理局、國家發改委的醫療服務和藥品價格管理、勞動和社會保障部的醫療保險、民政部的醫療救助、國家質檢總局的國境衛生檢疫等相關職能。
國土交通省（MLITT）負責土地規劃、河流、城市、住房、道路、港口和政府建築的建設和維護。它相當於我國的國土資源部、交通部、水利部和鐵道部。
外交部：相當於我國的外交部。
國防部：相當於我國的軍事委員會和國防部。
財政部：又稱財政部。相當於財政部。
經濟產業省：（日語：けいざいさんぎょうしょう），隸屬於日本中央省。其前身是通商產業省。它負責提高民間經濟的活力，順利發展對外經濟關系，確保經濟和產業的發展，穩定和維持礦產資源和能源的供應效率（《經濟產業省設置法》第 3 條）。它相當於我國的商務部。
農林水產省：（日語：のうりんすいさんしょう，英語：The Ministry of Agriculture, Forestry and Fisheries）：日本農林水產省），簡稱農林水產省。農林水產省管轄農牧業、林業、水產業、食品安全、食品穩定供應和鄉村振興。
法務省：（日語：ほうむしょう，英語：Ministry of Justice）是維護基本法律制度、制定法律、保護人民權利、統壹處理涉及國家利益的訴訟的行政機構。在壹般情況下，國務大臣由司法大臣取代。在《大日本帝國憲法》時期，法務省的前身是法務省。
文部科學省（MEXT）是日本中央政府的行政機關之壹，負責協調教育、科技、學術、文化和體育等事務。自 2001 年 1 月 6 日起，文部科學省由原文部省和原文部省領導。自 2001 年 1 月 6 日起，文部科學省並入文部省。它相當於我國的文化部、教育部、科技部、體育總局和宣傳部。
環境省：相當於環境保護部。