市財政局內設辦公室、綜合科、稅政條法科、預算科、政府采購科、國庫科、行政事業科、經濟建設科、農業科、農業綜合開發辦公室、社會保障科、企業科、金融外資科、會計科、農村財政管理局、財政監督局、行政資產管理科、企業資產科、業績與人事考評科、監事會管理辦公室。下屬機構國庫支付中心、非稅收入管理局、註冊會計師管理辦公室、信息中心、中華會計函授學校等單位。
各科室職能如下： （ 1 ） 、統壹受理壹級預算單位匯總的用款申請；
（ 2 ） 、對預算單位的財政資金進行審核、撥付、核算和監督管理；
（ 3 ） 、按照政府收支分類和會計核算的要求，建立帳冊管理體系；
（ 4 ） 、按照市級財政統發工資範圍進行工資統發；
（ 5 ） 、建立支付信息數據庫，向有關部門提供查詢全面、及時、準確的支付信息。 ( 1 ) 、負責全市政府非稅收入制度、辦法的擬訂，並組織實施和監督檢查；
( 2 ) 、負責市本級執收單位年度政府非稅收入計劃的編制審核、匯總、組織執行和決算審核、匯編工作；
( 3 ) 、負責全市政府非稅收入的票據購領、發放、繳銷和日常管理工作；
( 4 ) 、負責全市政府非稅收入的收費項目和收費性質審定的日常管理工作，配合有關部門對政府非稅收入收費標準的審查；
( 5 ) 、負責市本級政府非稅收入預算外財政專戶和財政匯繳結算賬戶的日常管理和會計核算工作；
( 6 ) 、負責市本級政府非稅收入征收管理工作；
( 7 ) 、配合市財政局監督機構對市本級政府非稅收入年度稽查工作，會同有關部門對政府非稅收入的收費年審工作；
( 8 ) 、負責對全市政府非稅收入征收管理工作的指導，完成市財政局交辦的其他工作任務。 市區唯壹從事各種會計類培訓的專職機構。
（1）承擔市區會計人員繼續教育定點培訓工作；
（2）開展會計從業資格考試培訓；
（3）開展會計電算化考試培訓；
（4）開展會計專業技術資格考試培訓；
（5）開展註冊會計師資格考試培訓；
（6）承擔全市會計電算化考試的考點工作；
（7）承擔我市就業再就業技能（會計類）定點培訓等。 根據授權，集中管理市直行政事業單位房屋及土地等公建物業的國有資產（產權）、置換利用和處置，監督使用單位合理、有效維護公建物業，統壹運營和監督管理市直行政事業單位經營性公建物業。