（壹）擬訂藥品、醫療器械、化妝品和消費環節食品安全監督管理的政策、規劃並監督實施，參與起草有關法律、法規和部門規章草案。
（二）負責消費品食品衛生許可和食品安全監督管理工作。
（三）擬訂消費環節食品安全管理規範並監督實施，開展消費環節食品安全狀況調查和監測，發布消費環節食品安全監管相關信息。
（四）負責化妝品衛生許可、衛生監督管理和化妝品審批工作。
（五）負責藥品、醫療器械的行政監督和技術監督，負責制定藥品、醫療器械研制、生產、流通、使用的質量管理標準並監督實施。
（六）負責藥品、醫療器械的註冊和監督管理，擬訂藥品、醫療器械國家標準並監督實施，組織開展藥品不良反應和醫療器械不良事件監測，負責藥品、醫療器械再評價和淘汰工作，參與擬訂國家基本藥物目錄，配合有關部門實施國家基本藥物制度，組織實施處方藥和非處方藥分類管理制度。
（四）組織實施處方藥和非處方藥分類管理制度。
（七）負責擬訂中醫藥、民族藥監督管理規範並組織實施，擬訂中醫藥、民族藥質量標準，組織擬訂中藥材、中藥飲片生產質量管理規範並監督實施，組織實施中藥品種保護制度。
（八）監督管理藥品、醫療器械質量安全，監督管理放射性藥品、麻醉藥品、毒性藥品和精神藥品，發布藥品、醫療器械質量安全信息。
（九）組織查處消費環節食品安全和藥品、醫療器械、化妝品等研制、生產、流通、使用的違法行為。
（十）指導地方食品藥品監督管理、應急處置、稽查和信息化建設工作。
（十壹）制定和完善執業藥師資格準入制度，指導和監督執業藥師註冊工作。
（十二）開展食品藥品監督管理相關國際交流與合作。
（十三）承辦國務院和衛生部交辦的其他事項。