在日本歷史上，曾經發生過至少2次“殺人疫苗”事件。
壹次是1979年百日咳DPT疫苗事件，先說說日本的疫苗制度，日本家庭可以從所屬區役所領取到壹本《母子健康手帳》，裏面會記載疫苗的種類和接種時間表。日本疫苗分兩種，壹種叫“定期接種”，大概有10幾種，是免費的，另外還有壹種叫“任意接種”，屬於自費項目。百日咳當時屬於定期接種，由於百日咳疫苗出現大批過敏癥狀，後來緊急叫停，導致1萬多名患者犯病，死亡人數據統計超過40人。
另外壹次則更加有名，那是發生在1996年的壹起嚴重事件，日本的免費接種疫苗有10幾種，但是不包括常見的乙肝疫苗，乙肝疫苗需要自費，價格大概18萬日元，相當於壹萬多塊錢人民幣。因為很多家長怕孩子得乙肝，所以盡管是自費，也都會帶孩子去打乙肝疫苗，這就促使乙肝疫苗市場火爆，供不應求，常常得提前預約排隊才能打上。
也許是因為暴利，日本疫苗生產廠家綠十字制藥公司便急於擴大生產規模，忽視了生產質量，終於導致疫苗原料中使用了艾滋病和肝炎患者的血清，甚至導致部分接種者感染了艾滋病和肝炎。更嚴重的是，事發之後，負責監管藥品的日本厚生省竟然掩蓋真相，沒有及時向公眾告知事實真相，導致了更嚴重的後果。
後來，根據統計，至少有數千名接種者感染了艾滋病病毒，時任厚生大臣在輿論壓力下承認錯誤，原日本厚生省管理疫苗的官員松村被逮捕起訴，綠十字制藥公司的董事長等人也被起訴。
其實，當時日本的藥品管理市場是非常混亂的，1994年，新型抗病毒藥物“索利夫定”竟然在發售壹個月之後，就導致15名患者死亡，震驚了日本朝野。“殺人藥品”余波未了，“殺人疫苗”又橫空出世。
從此，日本加強了疫苗監管，雖然依然出現疫苗事故，但類似的大規模“殺人疫苗”沒再出現。