制藥工程專業畢業後可到各類各級企事業單位從事中藥、化學藥、生物藥物的研發、質控、生產、管理、經營等工作。
該專業要求學生掌握化學、藥學、制藥工程和化學工藝等方面的基礎理論和基本知識，掌握藥物合成，有機精細化學品的基本合成、改性和配方的基本原理和基本技能，培養具有制藥過程方面的生產、經營管理、科研開發、應用研究的高級工程技術人才。
培養掌握制藥工程專業及相關學科的基本理論和專業知識，具有良好的創新意識、創業精神和職業道德，具備分析、解決復雜工程問題的能力以及創新創業能力，能夠在制藥及相關領域從事科學研究、技術開發、工藝與工程設計、生產組織、管理與服務等工作的高素質專門人才。
基本業務要求
1、掌握制藥工程及相關學科的基礎知識與基本理論，以及制藥工程領域科學研究、技術開發、工程設計的研究方法和技術手段；了解制藥工程的學科前沿、專業現狀及發展趨勢，了解藥品研發、生產、工程設計等相關的技術標準與政策法規。
2、具有應用現代信息技術獲取專業相關信息的基本能力；具備從事制藥工程技術改造與創新、工藝工程設計與分析等解決復雜工程問題的基本能力；具有良好的質量、安全、環境保護和健康意識，以及應對藥品生產相關突發事件的基本能力；具備良好的創新創業意識和開展創新創業實踐活動的基本能力。
3、具有良好的語言表達、人際交往、團隊協作和組織管理能力；具有壹定的國際視野和跨文化交流與合作能力；具有終身學習的意識和適應行業發展的能力。