1、起付錢不同。如果是急診，可以不用在當地報備。非急診的必須報備，否則不能異地報銷以及回醫保歸屬地報銷。在異地就醫時，報銷的藥品目錄、診療項目、服務設施能不能報銷，以就醫的城市當地報銷範圍為準；
2、個人賬戶不同。本地戶口的醫保有個人賬戶，也就是醫保卡內有錢，可以刷卡買藥，可以享受門診報銷，外地戶口的醫保是沒有個人賬戶的，只能享受住院報銷；
3、社保轉移不同。如果現在的城市沒繳納過社保，是要新開戶繳納的之前在其他城市、其他省的社保是需要辦轉移的，不轉移之前交的就作廢了，不會自動累計到新的賬戶。
異地辦理醫療報銷的流程是：
1、在住院前或住院後3日內打老家新農合咨詢電話對住院就醫情況進行登記備案；
2、出院後必須在居住所在地由街道辦事處或居委會出具壹份居住證明，如果是在外務工，需有務工單位出具務工證明；
3、出院後持相關材料回參合所在地報銷；
4、如果是從參合所在地直接到省外住院化療，必須在走之前辦理轉診轉院手續，然後才可去外地住院治療；
5、省外報銷的比例最低，壹般起付線2000左右，報銷比例為合理費用的45%，花的少的話，很難報銷幾個錢的，醫院級別越低，報銷比例越高。
綜上所述，報銷比例壹樣，但起付錢不壹樣。如果是急診，可以不用在當地報備。非急診的必須報備，否則不能異地報銷以及回醫保歸屬地報銷。在異地就醫時，報銷的藥品目錄、診療項目、服務設施能不能報銷，以就醫的城市當地報銷範圍為準。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》第二十三條
職工應當參加職工基本醫療保險，由用人單位和職工按照國家規定***同繳納基本醫療保險費。
無雇工的個體工商戶、未在用人單位參加職工基本醫療保險的非全日制從業人員以及其他靈活就業人員可以參加職工基本醫療保險，由個人按照國家規定繳納基本醫療保險費。