制藥工程專業考研方向主要集中在：藥物化學、化學工程與技術、藥學、中藥學。
制藥工程專業考研方向1：藥物化學
專業介紹
藥物化學是壹級學科藥學下設的二級學科，本專業是培養能在科研與開發生產領域從事藥物合成、藥物設計和功能基因藥物的研究，藥品監督和管理的高級專業人才。本專業的畢業生具有在高校、科研機構及企業從事教學、科研及新產品、新設備、新工藝的開發研究等專門技術工作的能力。掌握現代化學合成藥物和天然藥物提取、合成新工藝和手性技術的研究方法，能獨立地、創造性地開展新藥研究與開發，具有分析問題、解決復雜疑難問題的能力。
就業方向
藥物化學專業的畢業生就業前景還是不錯的，尤其是男生就業比較樂觀，在藥學領域，單從技術上考慮，藥物化學是最有前途的，薪資也比較高。該專業的畢業生就業方向為各類藥物研究單位，有機化學研究所、醫藥生產企業和藥政機構等單位，也可從事高等學校的教學工作。
制藥工程專業考研方向2：化學工程與技術
專業介紹
化學工程與技術專業擁有化學工程與技術及分析化學、高分子化學與物理、材料物理化學等相近學科。結合生物質能源、新能源、綠色化學品等特色優勢，通過不斷凝煉學科方向，本學科確立了四個學科方向。
就業方向
本專業學生主要在化工、煉油、冶金、能源、輕工、醫藥、環保和軍工等部門從事工程設計、技術開發、生產技術管理和科學研究等方面工作。
制藥工程專業考研方向3：藥學
專業介紹
藥學專業培養具備藥學學科基本理論、基本知識和實驗技能，能在藥品生產、檢驗、流通、使用和研究與開發領域從事鑒定、藥物設計、壹般藥物制劑及臨床合理用藥等方面工作的高級科學技術人才。業務培養要求：本專業學生主要學習藥學各主要分支學科的基本理論和基本知識，受到藥學實驗方法和技能的基本訓練，具有藥物制備、質量控制評價及指導合理用藥的基本能力。
發展前景
社會對藥學人才的需求正在增加，本專業的大學生就業率高達95%。制藥業發展較快，尤其是生活水平提高以後，人們對保健品的需求在增大，企業對藥學人才比較青睞。還有壹塊就是生化藥品，這是壹個新興也是尖端的行業，發展前景很好。
制藥工程專業考研方向4：中藥學
培養目標
中藥學專業培養具備中藥學基礎理論、基本知識、基本技能以及與其相關的中醫學、藥學等方面的知識和能力，能在中藥生產、檢驗、流通、使用和研究與開發領域從事中藥鑒定、設計、制劑及臨床合理用藥等方面工作的高級科學技術人才。
就業方向
中藥學主要從業領域為：中藥檢驗、中藥研究、中藥新藥開發、醫藥院校、藥廠、醫院、醫藥公司等方面的技術工作。