由於需要的營養成分不同，培養基也有很多種。據估計，目前有成千上萬種不同的介質，根據其成分、物理狀態和用途的不同，可以分為幾種類型。
1.根據培養基的組成來確定培養基的成分。
媒體按成分可分為合成媒體、天然媒體和半合成媒體。
(1)合成培養基。合成介質的成分都是已知的化學物質。這種培養基化學成分明確，成分準確，重復性強，但價格昂貴，微生物在這種培養基中生長緩慢。如高的1號合成培養基、查氏培養基等。
(2)天然培養基。用天然物質做成的，比如蒸土豆和普通牛肉湯，前者用來培養黴菌，後者用來培養細菌。這種培養基的化學成分很不穩定，難以確定，但配制方便，營養豐富，所以經常使用。
(3)半合成培養基。在天然有機物的基礎上適當添加成分已知的無機鹽，或者在合成培養基的基礎上添加壹些天然成分，如培養黴菌的馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養基。這種培養基能更有效地滿足微生物對營養物質的需求。
2.根據培養基的物理狀態來選擇培養基。
培養基按其物理狀態可分為固體培養基、液體培養基和半固體培養基三種。
(1)固體培養基。培養基中加入凝結劑，如瓊脂、明膠和矽膠。固體培養基常用於微生物的分離、鑒定、計數和菌種保藏。
(2)液體培養基。不向液體培養基中添加凝結劑。這種培養基成分均勻，微生物能充分接觸和利用培養基中的營養物質，適合於生理研究。因其發酵率高，操作方便，也常用於發酵工業。
(3)半固體培養基。它是在液體培養基中加入少量凝結劑形成的半固態。它可以用來觀察細菌的運動，鑒定菌株和確定噬菌體的滴度。
3.根據微生物的類型
根據微生物的種類，培養基可分為四類:細菌培養基、放線菌培養基、酵母培養基和黴菌培養基。
常用的細菌培養基有營養肉湯和營養瓊脂培養基；放線菌常用的培養基是高的1培養基；常用的酵母培養基有馬鈴薯蔗糖培養基和麥芽汁培養基；常用的黴菌培養基有馬鈴薯蔗糖培養基、豆芽汁葡萄糖(或蔗糖)瓊脂培養基和夏加爾培養基。
4.根據培養基的用途。
根據其特殊用途，培養基可分為增菌培養基、選擇培養基和鑒別培養基。
(1)富集培養基。就是在培養基中加入血液、血清、動植物組織提取物，培養壹些苛求的微生物。
(2)選擇性培養基。它是根據某種微生物的特殊營養需求或其理化抗性而設計的培養基。通過使用這種培養基，可以從混合微生物中分離出所需的微生物。
(3)培養基的鑒定。就是在培養基中加入壹些試劑或者化學物質，培養後進行壹些改變，從而區分不同類型的微生物。