首都醫科大學創建於1956年，是北京市重點高等院校，是北京市政府、國家衛生健康委員會、教育部***共建院校。已故著名泌尿外科專家、兩院院士、全國人大常委會副委員長吳階平教授擔任首任校長。現任黨委書記為胡文亮研究員，校長為我國著名分子神經生物學家饒毅教授。
學校設有基礎醫學院、藥學院、公共****、護理學院、生物醫學工程學院、中醫學院、醫學人文學院、全科醫學與繼續教育學院、馬克思主義學院、國際學院、燕京醫學院、腦重癥研究中心、附屬衛生學校等10院1系1研究中心和附屬衛生學校。附屬衛生學校。學校有 21 所臨床醫學院（其中 19 所為附屬醫院），包括首都醫科大學宣武醫院（第壹臨床醫學院）、北京友誼醫院（第二臨床醫學院）、朝陽醫院（第三臨床醫學院）、同仁醫院（第四臨床醫學院）、天壇醫院（第五臨床醫學院）、安貞醫院（第六臨床醫學院）、復興醫院（第四臨床醫學院）、復興醫院（第六臨床醫學院）。復興醫院（第八臨床醫學院）、北京佑安醫院（第九臨床醫學院）、北京胸科醫院（第十臨床醫學院）、首都醫科大學三博腦科醫院（第十壹臨床醫學院）、北京地壇醫院（第十二臨床醫學院）、北京兒童醫院（兒科學院）、北京口腔醫院（口腔醫學院）、北京安定醫院（口腔醫學院）。口腔醫學院）、北京安定醫院（精神衛生學院）、北京婦產醫院（婦產科學院）、北京中醫醫院（中醫臨床醫學院）、北京世紀壇醫院（腫瘤醫學院）、北京康復醫院（北京康復醫學院）、北京潞河醫院（潞河臨床醫學院）、中國康復研究中心（康復醫學院）、中日友好醫院（中日友好醫院臨床醫學院）、預防醫學教學基地（北京市疾病預防控制中心）。學校還設有 38 個臨床醫學院（系）和 32 個臨床治療中心。
學校現有全日制在校生12422人，其中研究生4648人，本科生5309人，高中生1765人，留學生700人，成人學生3121人。學校及附屬醫院現有教職工和醫務人員42791人（校本部1470人，附屬醫院41321人），其中院士7人，正高職稱2596人，副高職稱4164人；教授944人，副教授1303人；博士生導師689人，碩士生導師1124人。
學校擁有8個國家重點學科，2個國家重點（培育）學科；60個國家臨床重點專科（含中醫）；14個國家中醫藥管理局重點（培育）學科；4個北京市壹級重點學科，6個北京市二級重點學科，1個北京市重點交叉學科，1個北京市高等學校學科群。學院臨床醫學、神經科學與行為學、藥理學與毒理學、免疫學、生物學與生物化學、分子生物學與遺傳學、社會科學總論7個學科進入ESI學科全球前1%排名，其中，臨床醫學進入ESI學科前1‰，神經科學與行為學、藥理學與毒理學進入全球前5‰。
有8個壹級學科博士學位授權點，13個壹級學科碩士學位授權點；按三級學科統計，有59個博士學位授權點，77個碩士學位授權點；擁有所有醫學及醫學相關學科的碩士、博士學位授予權。有 9 個博士後科研流動站。學校在臨床醫學、兒科學、口腔醫學等專業設置了長期的學科建設；本科專業有臨床醫學、基礎醫學、口腔醫學、兒科學、預防醫學、精神病學、藥學、臨床藥學、中醫學、中藥學、護理學、生物醫學工程、假肢與矯形工程、康復治療學、聽力與言語康復、公共 **** 職業管理（衛生管理）、法學（衛生法學）、醫學檢驗技術、醫學檢驗技術、醫學檢驗技術與醫學檢驗醫學、衛生管理（衛生管理）、醫學檢驗技術與醫學檢驗醫學。)、醫學檢驗技術、醫學檢驗技術、醫學影像技術、信息管理與信息系統（衛生信息管理）、眼視光、衛生檢驗與檢疫、助產等24個專業；高等職業專科教育設有護理、醫學檢驗技術、藥學等14個專業。學校培養醫學及醫學相關學科的學術型、應用型人才，形成了全方位、多層次、創新型的人才培養模式。
學校現有教育部、國家衛健委 "卓越醫生教育培養計劃 "試點項目6個；國家級特色專業7個，市級特色專業10個，北京市壹流特色專業2個；國家級精品課程7門，市級精品課程18門，國家級精品資***享課程5門，國家級精品視頻公開課1門；國家級精品視頻公開課3門，國國家級精品視頻公開課；國家級實驗教學示範中心 3 個、市級實驗教學示範中心 6 個，國家級人才培養模式創新實驗區 3 個、市級人才培養模式創新實驗區 1 個，國家級大學生校外實踐教育基地 1 個，北京市校外人才培養基地 5 個，素質教育基地 1 個；國家級優秀教學團隊 7 個，黃大年式教學團隊 1 個，市級優秀教學團隊 11 個；國家級教學名師 1 人，市級教學名師 24 人，青年教學名師 1 人，"高創項目 "教學名師 3 人。學校 **** 獲國家級教育教學成果特等獎 1 項、二等獎 7 項、優秀獎 1 項，市級特等獎 2 項、壹等獎 22 項、二等獎 34 項、優秀獎 1 項。學校2014年高水平通過教育部臨床醫學專業認證，2018年教育部本科教學工作審核評估專家組對學校本科教學工作給予充分肯定。
學校擁有國家兒童醫學中心1個，國家臨床醫學研究中心6個；省部級***建國家重點實驗室培育基地1個，教育部重點實驗室5個，省部級***建協同創新中心1個，北京市實驗室1個，北京市重點實驗室54個；國家工程實驗室1個，國家工程技術研究中心1個，教育部工程技術研究中心4個，北京市工程技術研究中心10個。國家工程實驗室 1 個，國家工程技術研究中心 1 個，教育部工程研究中心 4 個，北京市工程技術研究中心 10 個；教育部創新團隊 3 個，科技部重點領域優秀創新團隊 3 個。人腦保護高精尖創新中心 "獲批首批北京市高精尖中心。除擁有壹批國家級、市級重點學科和重點實驗室外，學校還建有國家生命科學與技術人才培養基地、原衛生部全科醫學培訓中心、北京市全科醫學培訓中心、首都衛生管理與政策研究基地等國家級、市級高水平科研培訓機構。五年來，學校承擔了壹批國家級、市級重點學科和重點實驗室。五年來，學校承擔國家重點研發計劃、國家科技重大專項、國家自然科學基金、國家社會科學基金、北京市科委、北京市自然科學基金等科研項目2940項（其中國家級科研項目1545項），累計科研經費26.62億元（其中國家級項目經費20.64億元）。獲各級獎勵 85 項，其中國家科技進步獎 8 項，北京市科學技術獎 37 項，教育部高等學校科學研究優秀成果獎 5 項，中華醫學科技獎 22 項，吳階平系列醫學藥學獎 6 項，茅以升北京青年科技獎 2 項，何梁何利科學技術獎 1 項，中原協和生命醫學獎 2 項；北京市哲學社會科學優秀成果獎 1 項、北京市優秀調查成果獎 1 項。獲授權專利 649 項。
學校建有圖書館、檔案館、校史館、中心實驗室、信息中心、實驗動物部、學術期刊編輯部、校醫院等公共**** 服務平臺。