腸鏡醫保不壹定可以報銷。
如果是在門診進行的腸鏡檢查，那麽只能用醫保個人賬戶進行支付，而不能用醫保統籌賬戶報銷，當然，如果醫保卡個人賬戶裏面沒錢了；那麽相關醫療費用也就只能由參保人自己支付了。但是，如果是因為較重疾病住院，而必須需要進行腸鏡檢查，則可以用醫保統籌賬戶報銷。
壹、醫療保險是什麽
壹般指基本醫療保險，是為了補償勞動者因疾病風險造成的經濟損失而建立的壹項社會保險制度。通過用人單位與個人繳費，建立醫療保險基金，參保人員患病就診發生醫療費用後，由醫療保險機構對其給予壹定的經濟補償。基本醫療保險制度的建立和實施集聚了單位和社會成員的經濟力量，再加上政府的資助，可以使患病的社會成員從社會獲得必要的物資幫助，減輕醫療費用負擔，防止患病的社會成員“因病致貧”。
二、醫保報銷的費用項目是
1、床位費鄉鎮衛生院最高12元/天，市級及市級以上醫療機構最高15元/天。
2、藥品費藥品使用範圍執行省規定的藥物目錄。
3、檢查360問答費檢查、化驗等，限額600元。
4、治療費300元以內按實結算，300元以上部分按50%納入報銷範圍。
5、手術費按規定收費標準執行。
6、輸血費手術或搶救，每次住院最高限額500元。
7、材料費每次住院最高限額2000元。
8、各種腫瘤患者的放、化療及腎功能衰竭需要透析的門診費用，視同住院費用進行補償。
三、新農合醫保和城鎮醫保的區別如下
1、人群不同。城鎮居民醫保主要是覆蓋城鎮戶口的居民，新農合主要是覆蓋農村戶口的居民；
2、管理部門不同。城鎮居民醫保主要由人社部門管理，新農合多數地方由衛生部門管理；
3、購買方式不同。新農村合作醫療是農村戶口的買，居民醫療保險是非農業戶口的買；
4、報銷比例不同。城鎮居民醫療保險的報銷比例是85%，根據不同等級的醫院，新農合的報銷比例在10%-80%不等；
5、報銷藥品不同。新農合可報銷的藥品目錄比城鎮醫保要少，還有新農合在鄉鎮醫院報銷比例高，在市級醫院平均報銷比例比城鎮醫保低10%-20%，最高封底也比城鎮醫保少；
6、保障待遇側重點不同。城鎮居民醫保主要保住院和門診大病兼顧普通門診，所以住院及門診大病待遇都要高於新農合。另外新農合的門診待遇水平總體要高於城鎮居民醫保。
四、胃腸鏡是自費項目嗎
1、通常普通人群在門診做胃腸鏡都是自費。住院期間做普通胃腸鏡，有醫保的可以報銷，無痛胃鏡的麻醉藥物等需要自費。不同地區有所差異，有的地方可以報銷，具體應咨詢當地醫院。
2、普通胃腸鏡簡單快捷、經濟實惠，可能出現嘔吐、惡心等表現，而且由於部分被檢查者無法耐受可能會影響檢查過程。通常做壹次普通胃腸鏡價格在500～700之間，不同醫院收費價格可能存在差異。
3、無痛胃腸鏡，在檢查過程中比較舒適，有利於醫生進行仔細檢查，但是需要用麻醉藥，價格較高，麻醉藥是需要自費的。無痛胃腸鏡總***在1500～2000左右，具體價格應咨詢當地醫院。
4、胃腸鏡檢查是否自費應結合個人情況和醫院情況來看，可以到醫院或體檢中心詳細咨詢。
五、醫保不能報銷的項目
1、是服務項目類：掛號費、院外會診費、病歷工本費等；出診費、檢查治療加急費、點名手術附加費、點名手術附加費、優質優價費、自請特別護士等特需醫療服務。
2、是非疾病治療項目類：各種美容、健美項目以及非功能性整容、矯型手術等；各種減肥、增胖、增高項目；各種健康體可償還；各種預防、保健性的診療項目；各種醫療咨詢、醫療鑒定。
3、是診療設備及醫有用材料類：應用正電子發射斷層掃描裝置（PET）、電子束CT、眼科準分子激光治療儀等大型醫療設備進行的檢查、治療項目。眼鏡、義齒、義眼、義肢、助聽器等康復性器具。各種自用的保健、按摩、檢查和治療器械。各省物價部門規定不單獨收費的壹次性醫用材料。
4、是治療項目類：各類器官或組織移植的器官源或組織源；除腎臟、心臟瓣膜、角膜、皮膚、血管、骨、骨髓移植外的其他器官或組織移植；近視眼矯形術；氣功療法、音樂療法、保健性的營養療法、磁療等輔助性治療項目。
5、是其他類：各種不育（孕）癥、性功能障礙的診療項目；各種科研性、臨床驗證性的診療項目。