背景:隨著調查的深入，這個黑暗組織逐漸浮出水面，工藤優作發現了這個組織的
事情很嚴重，所以我請求國際刑警組織介入。在日本警方和柯南的幫助下，被阻止了幾次。
黑暗集團決定對其活動進行報復。
黑暗集團伏擊了阿笠博士的家，抓住了少年偵探組，並留下了重要的工人。
暗示藤壹獨自去營救。
在黑暗組織總部，Gin發現了Ai的真實身份，並以壹個少年偵探隊的生活為背景。
他被命令制作壹種縮小藥的解毒劑。經過仔細考慮，他已經在壹天之內做出了解決方案。
藥和假死丸，又巧妙地把胖子的毒改成了假死丸。杜松子酒真的解決了。
吃了藥後，他命令胖子殺了阿裏和少年偵探隊。....
柯南很快揭開了暗示的奧秘，趕到了黑暗組織的總部，壹切都被蘭看到了。
在蘭的要求下，小五郎和警察對這個建議進行了壹番思考，小五郎睡著了。
壹個突然的靈感揭開了謎底。
黑暗的總部裏，出現了組織老大大狗，原來是日本內閣大臣。大狗道
揭露黑暗組織的秘密:裕仁天皇臨終時留下了壹本血書。
內閣認為建立黑暗組織是皇帝的遺願，所以黑暗組織壹直掌權
政府暗中支持，按兵不動。幾十年後，該組織仍然無法真正揭開這本血腥的書。
意義。
Gin給Ai服下解藥後告訴胖子釋放Ai。交給那個對大哥百依百順的胖子吧。
突然杜松子酒被擊落了。真正的杜松子酒出現了，並透露他以前是基德。
假裝。
這時大狗說基德的父親其實是該組織的特工，從事盜竊，然後
因為組織的行為而被迫承擔冒犯外國的罪責。
克裏斯(女老師)告訴柯南這是心怡的秘密，並給了柯南壹本血書，要求
它解開了血書之謎，用解藥引誘它縮藥。柯南解開了血書之謎，事實證明
是天皇臨死前寫的，對日本的前途憂心忡忡。大狗立刻呆在那裏。
位置.....
蘭趕到現場，遇到琴酒要求柯南留下遺言。柯南把真相告訴了蘭，坦白了。
Gin開槍後，Lan替柯南擋住了子彈。艾對此感到震驚。.......
柯南終於在關鍵時刻用麻醉槍射死了琴酒，艾在搏鬥中與胖子在壹起。
從樓上摔下來。
對毒品有很強抵抗力的Gin，竟然在射殺了壹條大狗之後，清醒過來想要殺死柯南。對吧
coolguy非常欣賞的Cris攔住了他們，兩人都受了重傷。
工藤優作、高五郎、蔣木木和其他人到達，高五郎與該組織的爪牙作戰。
開槍很英雄。
在眾人的圍追堵截下，金暴露了自己的野心，以及作為皇帝和美國女人的身份。
政治家吉諾在私生子的秘密曝光後自殺了。克裏斯現在說他是被美國陷害的。
組織裏的間諜，原來美國也想控制組織。
基德走後，大家趕緊把蘭和艾送到醫院，驚訝地發現艾又變了。
回到孩子身邊。
黑暗組織被檢測到了，但只剩下壹種解毒劑。艾被診斷為腦震蕩，醒了。
我只記得每個人的名字，其他的都忘了。蘭還在昏迷中，醫生說
如果長時間昏迷，可能會變成植物人。服部哲建議柯南成為喚醒蘭和柯南的新人。
這是唯壹的辦法。而柯南變身的時候，布美看到了他。
半夜，步美來到病房，偷吻後離開，與廣彥和元太保守約定。
新壹的秘密。
蘭在新壹的精心照料下終於康復了。
因為這個案子，大家都成了名人，蘭很難受。優秀的作品必須尋求新的
我和蘭壹起去美國上大學。公主回到毛利，要蘭去美國。還有毛利人
由於他的英勇表現，他被重新聘為警察局重案組的負責人。這時毛利透露他已經知道了。
柯南大壹，故意說實話。
夕陽下，欣怡很欣慰地看到艾和少年偵探隊玩得很開心。
在機場，他們告別了辛屹和蘭，只有艾偷偷轉過身來面對著賽爾。
紀和柯南哭的照片。......
(1)柯南終於打敗了黑暗組織，找到了找回身體的方法，與小蘭喜結連理。後來，他們有了愛情的結晶——壹個叫工藤柯南的男孩...
(2)柯南終於打敗了黑暗集團，找到了找回自己身體的方法，但蕭艾在與黑暗集團的決戰中被杜松子酒射殺，以掩蓋辛屹的不幸。新壹和小蘭* * *結婚了，後來他們有了愛情的結晶——壹個叫工藤石保的女孩...
(3)柯南最終打敗了黑暗集團，找到了找回自己身體的方法，但毛利小五郎在與黑暗集團的決戰中壯烈犧牲。心怡繼承了毛利偵探社，與小蘭結婚，改名為毛利心怡。後來，她和小蘭發生了戀情——壹個叫毛利洋子的女孩...
(4)小蘭知道柯南的真實身份後惱羞成怒，用空手道修理了柯南。結果，她使用了過多的武力，造成了不可挽回的悲劇...
(5)柯南終於打敗了黑暗集團，找到了找回身體的方法，但就在小蘭表白的前夕，小蘭出了車禍...
(6)在與黑暗集團的決戰中，小蘭不幸身亡...，智寶和辛屹跑了...
(7)所有人被黑暗組織抓住後，亂開槍...
(8)所有人都被黑暗組織抓住，捆住手腳扔進海裏餵鯊魚...
(9)柯南和金在與黑暗組織的決戰中同歸於盡...
(10)打敗黑暗集團後，柯南沒能變回來。向小蘭坦白自己的身份後，兩人移居美國，治療柯南的侏儒癥...
(11)柯南終於打敗了黑暗組織，找到了找回自己身體的方法，但蕭艾因為嫉妒，用APTX4869毒死了小蘭，毀藥逃跑。新的只好拿最後壹個APTX4869，又變成柯南了...
(12)柯南終
第十三種(自己寫的)柯南死的時候還沒寫完。