1.在社區定點醫療機構治療的壹般疾病，壹般人員支付比例為60%，城市困難人員支付比例為70%。
2、在社區定點醫療機構治療的特大疾病，壹般人員支付比例為80%，城鎮困難人員支付比例為90%；
3、在二級及以上定點醫療機構治療的壹般疾病，壹般人員支付比例為50%，城鎮困難人員支付比例為60%。
4、在二級及以上定點醫療機構治療的特殊病種，壹般人員支付比例為70%，城鎮困難人員支付比例為80%。
5.此外，慢性病醫療保險基金年度最高支付限額壹般病種為2000元，特大病種為10萬元。
報銷比例根據醫療機構級別不同而不同
各地醫療門診可收治的特殊病種不斷擴大，目前規定慢性特殊病種的報銷比例最高可達90%，如地中海貧血、血吸蟲病、肺結核、癲癇、兒童生長激素缺乏癥等，多達三十多種常見病。壹級醫療機構住院報銷比例為90%，二級醫療機構為80%，三級醫療機構為60%左右。
報銷比例因患者情況而異
各城市和各地區的實際情況也不盡相同。來自農村地區的貧困患者可以獲得最高 90% 的報銷比例，但前提是他們必須能夠證明自己的貧困狀況並符合報銷要求。
同時患有多種門診慢性病的，起付標準按就高原則計算：
同時患有多種門診特殊慢性病的參保人員，起付標準按病種就高原則計算，每個病種統籌基金年度支付限額分別單獨計算。門診特殊慢性病患者在門診發生的醫療費用納入個人年度統籌基金最高支付限額。經認定符合門診特殊慢性病待遇條件的，自相應病種認定之日起享受門診特殊慢性病待遇。
參保人員申報門診特殊慢性病待遇，原則上由各級醫療保險經辦機構組織認定工作。各統籌地區要優化參保人員門診特殊慢性病認定流程，暢通網上認定審批渠道，推進全區門診特殊慢性病認定信息****。各統籌地區可根據本地實際，將高血壓、糖尿病的認定權限下放至壹級定點醫療機構。
門診慢病患者選擇三級門診醫療服務定點：
患有門診特殊慢性病的參保人員，按規定到自治區備案或轉診，在參保人員選定的定點醫療機構以外的定點醫療機構接受門診治療的，統籌基金支付比例不降低；在本人選定的定點醫療機構以外的定點醫療機構接受門診治療的，不享受門診特殊慢性病待遇。
對於跨統籌區或跨系統轉入的參保人員，廣西區內門診特殊慢性病資格應互相認可。對區外參保人員跨省轉入的，參保人員在原地取得符合我區規定的門診特殊慢性病診療資格，簡化門診特殊慢性病認定程序，確保治療及時延續。
享受門診特殊慢性病待遇的參保人員選擇定點醫療機構實行年度備案制度。門診特殊慢性病患者在統籌地區內可選擇3家定點醫療機構作為門診醫療服務定點，外地就醫人員在居住地可選擇3家定點醫療機構作為門診特殊慢性病醫療服務定點，定點醫療機構原則上壹年壹定，中途不得變更；特殊情況需變更定點醫療機構的，可向參保地醫療保險經辦機構申請辦理變更手續。參保地醫療保險經辦機構可辦理變更手續。
統籌地區可結合自身管理條件，將符合條件的定點零售藥店提供門診特殊慢性病用藥服務納入門診特殊慢性病保障範圍，鼓勵定點醫療機構和 "雙渠道 "藥店提供 "互聯網+"診療和藥品配送服務。"診療和藥品配送服務，充分發揮定點零售藥店便捷可及的作用。
門診特殊慢性病38種：冠心病、高血壓（非高危、高危組）、糖尿病、甲亢、慢性肝炎鞏固治療、慢性阻塞性肺疾病、銀屑病、嚴重精神障礙、類風濕性關節炎、腦血管疾病後遺癥、系統性紅斑狼瘡、帕金森綜合征、慢性充血性心力衰竭、肝硬化、結核病（活動期）、再生障礙性貧血、腎病綜合征、癲癇、腦癱、重癥肌無力、風濕性心臟病、肺心病、強直性脊柱炎、甲狀腺功能減退癥、重型地中海貧血和中型地中海貧血、血友病、慢性腎功能不全（非腎透析）、腎透析、惡性腫瘤門診治療、器官移植抗排異治療、抗藥性肺結核、肺動脈高壓、老年癡呆癥、艾滋病、原發性免疫性血小板減少癥、心房顫動、支氣管哮喘（限於中度及以上）、抑郁癥（限於重度）38 種疾病。
法律依據：
《中華人民共和國社會保險法》
第二十八條_符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目和醫療服務設施標準以及急診搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。