1.概念不同
藥劑學專業是研究藥物配制理論、生產技術以及質量控制等內容的綜合性應用技術學科。其基本任務是研究將藥物制成適宜的劑型，保證以質量優良的制劑滿足醫療衛生工作的需要。藥學 專業是培養具備藥學學科基本理論、基本知識和實驗技能，能在藥品生產、檢驗、流通、使用和研究與開發領域從事鑒定、藥物設計、壹般藥物制劑及臨床合理用藥等方面工作的高級科學技術人才的學科。
2.課程不同
藥學專業的主要課程有馬克思主義基本原理、思想道德修養、法律基礎、大學英語、高等數學、醫用物理學、計算機基礎、形態學概論、生理學、細胞生物學、分子生物學、醫學免疫學、病理生理學、醫學微生物學、無機化學、有機化學、生物化學、定量分析、儀器分析、物理化學、基礎化學實驗、藥物化學、天然藥物化學、藥劑學、藥物分析、藥理學、毒理學基礎、藥物的波譜解析、藥事管理學、專業技能實驗等，藥劑專業的主要課程有物理化學、化工原理、藥物化學、藥物分析學、藥理學、物理藥學、藥用高分子材料學、生物藥劑學、工業藥劑學、制劑設備與車間工藝設計
3.培養目標不同
藥劑專業學生主要學習藥學、生物藥劑學、工業藥劑學、藥物制劑工程等方面的基礎理論和基本知識，受到藥物制劑研究和生產技術的基本訓練，具有藥物制劑研究、開發、生產技術改造及質量控制的基本能力，藥學專業業務培養要求：本專業學生主要學習藥學各主要分支學科的基本理論和基本知識，受到藥學實驗方法和技能的基本訓練，具有藥物制備、質量控制評價及指導合理用藥的基本能力。
4.就業方向不同
藥學專業的就業方向主要有下面四個方向科研人員——在大學、研究所、藥廠的研究部門，從事藥物的研發工作；醫院藥劑師——在醫院藥劑科、藥房、藥廠等從事制劑、質檢、臨床藥學等工作；藥檢人員——在藥檢所從事藥物的質量鑒定和制定相應的質量標準；公司職員、醫藥銷售人員——在醫藥貿易公司或制藥企業從事藥品生產、流通及銷售等工作。
藥劑專業的就業方向主要是藥物制劑學畢業後可從事藥物制劑研究、開發、生產及質量管理，能夠在制藥企業、醫院藥劑科、研究所及藥政管理部門從事藥物制劑研究、開發、生產、各類醫藥經營、生產單位和醫療衛生單位，從事藥品制劑、質檢、管理、購銷、問病給藥等工作。
藥物制劑專業就業崗位包括：藥物制劑研究員、制劑研究員、藥物分析、藥品研發 銷售人員、生產工藝員、藥物制劑、藥物制劑研發人員、藥物制劑項目經理、制劑工藝研究員、研發人員、藥品研發、制劑研發人員等等。
5.薪資待遇不同
其實藥學專業的薪資待遇和藥劑專業的薪資待遇也是有壹定的差別的，主要是在研發方面藥劑專業的研發薪資待遇更高壹點，而藥學專業的醫藥銷售代表的薪資待遇更高壹點。
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