目的是促進優質醫療資源擴大和區域均衡分布，堅持預防為主，加強重大慢性病健康管理，提高基層防治和健康管理能力。
發展和加強醫療衛生隊伍，重點放在農村地區和社區。促進中醫藥傳承、創新和發展，完善公共衛生體系，加強重大疫情防控和救治體系及應急能力建設，有效遏制重大傳染病傳播。
從六個方面深化醫藥衛生體制改革:
壹是強化政府責任和投入，確立政府在提供公共衛生和基本醫療服務中的主導地位。公共衛生服務主要由政府出資，向城鄉居民提供均等服務；基本醫療服務由政府、社會和個人共同承擔。
二是優化城鄉醫療服務體系結構，完善農村衛生服務體系，發展社區衛生服務體系。完善社區衛生服務功能，形成以社區衛生服務為基礎的新型城市醫療衛生服務體系，轉變基層醫療衛生機構運行機制，對政府舉辦的城市社區衛生服務中心、鄉鎮衛生院等基層醫療衛生機構實行收支預算管理。
三是改革醫院管理體制和運行機制，理順醫療衛生行政管理體制，推進醫療機構屬地化和全行業管理，嚴格醫療機構準入、經營、服務行為和質量監管。改革人事分配制度，建立激勵約束機制，調動醫務人員積極性，不斷提高服務質量和水平。
四是完善多層次醫療保障體系。到2008年底，新型農村合作醫療制度將基本覆蓋所有農村地區，並逐步提高籌資水平和報銷比例。到2010年底，城鎮職工基本醫療保險覆蓋全部城鎮職工，城鎮居民基本醫療保險全面推開。
五是建立國家基本藥物制度，制定國家基本藥物目錄，建立基本藥物生產供應體系，實行招標、定點生產或集中采購、直接配送，保障基本藥物生產供應，規範基本藥物使用，提高藥品儲備，保障人民基本用藥。
第六，加強衛生人才隊伍建設，重點加強公共衛生和基層專業技術人員、護理人員的培養、輸送和吸納。加強全科醫學教育，培養適合農村的衛生人才，制定優惠政策鼓勵優秀衛生人才到基層和中西部地區工作。培養中醫藥人才，加強中醫藥人才隊伍建設。