（壹）辦公室(外事辦公室)
負責組織制訂省局（公司）機關政務管理的規章制度，維護機關工作秩序；負責督辦省局（公司）局長、總經理辦公會議決定的事項；負責協助省局（公司）領導了解和掌握全面情況，協調部門間的工作，保證工作落實到位；負責承辦重要會議，組織起草重要材料；負責公文辦理、文秘、政務信息、檔案、機要、保密、信訪、外事、接待、統戰、值班等工作；負責督辦人大代表建議、政協委員提案；負責協調與煙草工業系統的關系；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（二）綜合計劃處（經濟運行處）
負責按照國家局、總公司的總體規劃和年度計劃，研究提出全系統中長期發展規劃和年度發展計劃；負責制訂、組織、實施全系統經濟運行調控方案，對經營活動進行綜合分析、預測監控，解決經濟運行中出現的重大問題；負責依法對煙草專賣品實施價格管理，收集、編發卷煙商情信息；負責編制、下達全系統年度卷煙和煙葉流轉計劃和季度計劃，調度全系統卷煙和煙葉流轉並進行庫存分析；負責全系統各項經濟指標的制訂和考核；負責全系統固定資產投資項目和基建項目的審批、報批和歸口管理工作；負責全系統對外經濟技術合作工作；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（三）專賣監督管理處（專賣稽查總隊、內部專賣管理監督處）
負責監督、檢查煙草專賣法律、法規及規章制度的貫徹執行情況；負責制訂並組織落實全省煙草系統工商企業有關專賣監督管理與內部專賣監督管理工作的規章制度；負責管理煙草專賣許可證、煙草專賣品準運證和其他各類專賣管理證件；負責監督檢查全省煙草專賣品的生產、經營活動，查處違法、違章案件，打擊不法行為，保護合法經營；負責組織協調全省卷煙打假打私工作；負責罰沒物品和罰沒款的管理工作；負責監督考核地市級局專賣管理工作；負責組織指導地市、縣級局對內部生產經營活動開展同級監管、日常監管，對下級局內管工作開展監督檢查；負責全系統行政執法錯案責任追究；負責專賣信息化建設的實施工作；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（四）政策法規與體制改革處
負責監督檢查國家有關法律、法規及行業規章制度的貫徹執行情況，研究提出貫徹落實的意見；負責審議全系統規章制度、規範性文件；負責制訂和組織實施全系統體制改革總體方案；負責全系統企業單位設立、分立、合並、撤銷等工作；負責研究法律法規、處理法律事務、法律咨詢和行政復議工作；負責審查省局（公司）及其所屬企事業單位的重大經濟合同；負責相關行政執法證件的管理工作；負責全系統法律法規宣傳教育、普法教育工作；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（五）財務管理處
負責對所屬企事業單位貫徹落實財經法規、財稅制度、財務會計政策和遵守財經紀律情況進行監督；負責制訂全系統財務管理制度；負責指導所屬企事業單位通過財務管理、預算管理、資產管理、資金管理、重大財務事項審批等工作，對所屬企事業單位資產經營實施內部監督和風險控制，保證國有資產保值增值；負責全系統大宗物資集中采購工作；負責資金管理中心工作；負責組織年度財務預、決算，編制財務報表，對財務狀況進行分析；負責組織實施會計電算化以及財務信息系統的管理工作；負責省局（公司）機關的核算和財務管理工作；負責制訂全系統國有資產增值保值率等考核指標，檢查考核各單位完成情況；負責調度、監督國有資產轉移、處置工作；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（六）審計處
負責組織指導全系統企事業單位開展審計工作；負責對所屬企事業單位實施財務收支和經濟效益情況進行審計；負責對所屬企事業單位違反財經法紀行為進行專案審計和專項審計調查並提出處理意見；負責對所屬企事業單位的負責人進行任期屆滿和離任經濟責任審計、經營目標責任審計及基建預決算審計；負責受理所屬企事業單位對審計結果的申訴；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（七）科技處
負責研究制訂全系統科技發展規劃；負責全系統的科技管理工作；負責承擔有關標準化工作；負責科技創新、科技交流合作、專利申報、成果推廣和獎勵工作；負責組織科技項目的申報、初審及相關管理工作;完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（八）人事勞資處（職業技能鑒定站、離退休人員管理處）
負責組織、管理全系統幹部人事、勞動工資、社會保險和人力資源配置工作；制訂全系統人事、勞資、教育、社保等工作的規章制度；負責省局（公司）黨組管理幹部和省局（公司）機關及直屬單位幹部的調配、任免、考評、晉級、獎懲、教育等工作；負責所屬企事業單位領導班子建設工作；負責全系統收入分配的宏觀調控，承擔薪酬委員會日常工作；負責省局（公司）機關勞動工資、勞保、福利的管理工作；負責所屬企事業單位內設機構、人員編制的審批和管理工作；負責省局（公司）黨組管理幹部及機關出國人員政審及因私護照管理工作；負責省局（公司）機關教育培訓工作，指導所屬企事業單位開展職工教育培訓；負責編制、修訂並落實全省行業鑒定工作的中長期工作規劃和年度鑒定計劃，實施全省行業職業技能鑒定的題庫管理、鑒定考核、證書管理、競賽管理及鑒定站質量管理體系的策劃、建立和運行；負責專業技術人員管理和中級專業技術職務任職資格評定、聘任工作；負責管理省局（公司）黨組管理幹部檔案；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（九）思想政治工作處（與機關黨委、機關工會合署辦公）
負責貫徹落實上級黨組織和省局（公司）黨組有關思想政治工作的精神；負責制訂全系統思想政治工作規劃、意見；負責組織和指導全系統的思想政治教育、精神文明建設、企事業單位文化建設等工作；負責開展機關黨建工作，了解和研究全系統基層黨組織建設狀況，指導所屬企事業單位配合地方組織部門開展黨建工作；負責全系統職工思想政治工作研究會的日常工作；負責省局（公司）機關工、青、婦等群眾組織的工作，指導全系統工會工作；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（十）監察處（與黨組紀檢組合署辦公）
負責維護黨的章程和其他黨內法規，保證黨的路線、方針、政策的貫徹執行；負責加強黨風廉政建設，開展黨風黨紀和廉政勤政教育，抓好黨風廉政建設責任制的落實；負責監督檢查行政監察對象貫徹執行國家法律、法規以及行業和省局（公司）有關規章制度的情況；負責履行同級監督職責，對省局（公司）黨組及其成員、行政監察對象和有關行政職能部門進行行政監察；負責受理所屬企事業單位黨組織、黨員和行政監察對象違法違紀行為的檢舉、控告；負責調查處理所屬企事業單位黨組織、黨員和行政監察對象違法違紀案件與其他重大問題，提出處理建議；負責受理黨員不服黨紀處分、行政監察對象不服政紀處分的申訴；負責完善監督機制，加強監督和再監督;完成上級紀檢監察機關和省局（公司）領導交辦的其他工作。
（十壹）安全保衛處
負責組織指導所屬企事業單位貫徹執行國家有關安全生產的法律、法規和政策並對執行情況進行監督檢查；負責制訂全系統安全保衛工作管理辦法、規範及標準並對執行情況進行監督檢查；負責應急處置、調查和協調處理全系統重大安全事故；負責監督檢查安全隱患整改措施落實情況；負責收集、整理全系統安全工作信息，通報安全工作情況；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（十二）投資管理處
負責監督管理全系統多元化投資工作；負責編制全系統多元化投資經營發展規劃，制訂多元化投資管理辦法和規章制度；負責省局（公司）機關及所屬企事業單位多元化投資項目的審核、報批工作；負責掌握、分析多元化經營發展動態，指導多元化企業的經營管理活動；負責監管多元化投資形成的資產，實現國有資產保值增值;完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（十三）煙葉管理處
負責貫徹執行煙葉收購的國家標準，國家局有關煙葉生產、收購和流通方面的方針、政策；負責制訂全系統煙葉管理工作的規章制度；負責全系統煙葉國家標準的管理工作；負責煙葉收購的監督、協調、服務工作；負責組織實施全省煙葉種植、收購、復烤、儲備和調撥計劃；負責全省煙葉購銷合同和加工合同的管理工作；負責全省煙草農業科技成果推廣應用和科技創新工作；負責做好全省烤煙產、供、銷的統計信息工作；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（十四）卷煙銷售管理處
負責規劃、指導、管理全系統卷煙銷售網絡建設及卷煙倉儲、運輸工作；負責制訂全系統卷煙經營發展規劃，指導所屬企業制訂本單位卷煙銷售的規章制度，監管所屬企業的銷售行為，檢查業務經營活動中規章制度的執行情況；負責組織實施全系統卷煙經營年度計劃，制訂卷煙經營考核辦法；負責調控全系統卷煙品牌和銷量；負責為卷煙訂貨貨源的組織和銜接做好協調服務；負責監督和檢查卷煙價格執行情況；負責建立全系統卷煙經營的信息平臺，進行全系統卷煙經營的運行情況分析，提供卷煙經營的決策信息支持；完成省局（公司）領導交辦的其他工作。
（十五）信息中心
負責編制與實施全省煙草系統信息化規劃；負責全省系統信息系統和數據中心及行業監管、業務應用管理、決策支持、平臺支撐四大信息管理體系的建設管理工作；負責全省系統信息網絡、數據通訊、系統的安全管理與運行維護；負責組織全省系統計算機軟、硬件招標采購工作；負責省局機關計算機系統建設管理及門戶網站的建設和運行維護；負責全省系統信息化工作隊伍建設工作。
（十六）煙草學會秘書處
負責系統學會學術研討活動；組織實施科研咨詢、學術交流；配合有關部門開展煙草科學技術普及工作，推廣先進生產技術和管理經驗；編輯出版《湖南煙草》雜誌；承擔系統通聯隊伍建設和管理；承擔系統有關宣傳報道工作；負責組織開展學會調研工作。
（十七）機關服務中心
負責省局（公司）機關固定資產和辦公用品的管理；負責機關設施、設備、動能管理；負責機關辦公費用和水、電、氣及房屋維修費用的成本控制和管理；負責機關生活福利和職工食堂及物資供應管理；負責機關環境、綠化和衛生管理；負責機關安全和社會治安綜合管理；負責機關工勤人員的勞務用工管理；負責機關職工的醫療保健管理；負責機關的車輛管理；負責機關與當地政府、社區及相關部門的工作協調。
（十八）湖南省煙草質量監督檢測站
負責對轄區內銷售或查獲的國內外卷煙產品的真偽鑒別檢驗，為卷煙打假提供技術支持；對轄區內的卷煙、煙葉和煙用材料等相關產品進行質量監督；承擔轄區內煙草產品的委托檢驗、新產品鑒定等有關檢驗檢測任務。
（十九）中國煙草中南農業試驗站
負責組織實施技術創新和重大科研項目攻關；負責煙草農業基礎科學和應用技術的研究；負責指導新技術的推廣與應用。