(1)不同的流程:
定點醫療機構應於每月10日前，將上月出院患者的費用清單、住院清單及相關資料上報醫療保險經辦機構，經審核後作為每月預撥和年終決算的依據。醫保經辦機構預撥上月特殊疾病住院和門診統籌費用。
參保人員因急診搶救到市內非定點醫療機構和異地醫療機構發生的醫療費用，由個人或單位先行墊付。急診搶救結束後，醫療保險經辦機構應當憑急診住院病歷、檢驗、化驗單、發票和醫療費用明細清單按規定辦理報銷手續。
(2)不同的範圍:
醫保卡報銷僅限於因病及部分意外在定點醫院發生的住院以上醫療費用。自費藥不報銷，乙類藥品80%報銷，床位費有限，部分檢查費和按規定的診療費不能報銷。在非定點醫療機構就診或在非定點零售藥店買藥(急診除外)，醫保不予報銷。
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(3)不同的醫療機構:
定點醫療機構是指通過與醫療保險經辦機構平等溝通、協商、協議，為參保人員提供醫療服務的醫療機構。包括公立醫療機構和具有壹定資質的民營醫療機構。在非醫保定點醫療機構(急診除外)發生的醫療費用，不按醫保政策報銷。
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