2001年，自主研發的生物活性多肽原料（中間體）被列為省級重大專項，同年經國家食品藥品監督管理局批準成立深圳翰宇藥業有限公司。
2002年，多肽藥物生產基地被列為 "深圳市高新技術產業化示範工程"，經深圳市政府批準在深圳高新區建設多肽藥物生產基地，同時被列為深圳市重大建設項目；多肽產品研發中心被列為深圳市工程技術研究開發中心；公司還承擔了國家 "863 "計劃和國家 "十五 "重大科技專項。
2003年，多肽藥物生產基地順利通過國家和省藥監部門驗收，取得《藥品生產許可證》和《藥品GMP證書》，同時承擔了廣東省重點領域重點突破項目。
2004年，多肽藥物生產基地被列為 "國家高技術產業化示範工程"，部分多肽藥物進入規模化生產和銷售。
2005年，公司承擔的國家 "863 "項目和國家 "十五 "重大科技專項順利通過科技部驗收；多肽研發中心被列為廣東省工程技術研究開發中心。
2006年，公司承擔的國家高技術多肽新藥產業化示範工程順利通過國家發改委驗收。
2007年，多肽藥物出口基地被列為 "國家高技術產業化示範工程"；通過 "全國產品質量和食品安全專項整治第三次現場會 "驗收；承擔國家 "十壹五 "規劃課題。翰宇入選 2007 年 "中國最具成長性科技企業 100 強"，榮獲 "深圳市科技創新獎 "和 "深圳市自主創新產業獎"，被認定為 "國家高技術產業化示範工程"。2007年，翰宇藥業入選 "中國最具成長性科技型企業100強"，榮獲 "深圳市科技創新獎 "和 "深圳市自主創新龍頭企業 "稱號。
2008年，翰宇與軟銀亞洲投資基金、深圳市創新投資集團合作，首期向翰宇投資1500萬美元；廣東省多肽藥物工程技術研究中心通過驗收；翰宇入選 "2008德勤高科技、高成長中國50強 "企業。公司入選 "2008德勤高科技、高成長中國50強企業"。
2009年10月28日，公司正式更名為 "深圳翰宇藥業股份有限公司"。
2009年10月28日，公司正式更名為 "深圳翰宇藥業股份有限公司"，先後承擔和參與了三項 "新藥創制 "科技重大專項和兩項國家高新技術產業化項目，並榮獲 "廣東省科學技術二等獎"。
2010年，公司被國家發改委授予 "國家高技術新型多肽藥物產業化示範工程 "稱號，並入選《福布斯》雜誌 "2010年中國潛力企業200強 "和 "德勤亞太區高成長企業"。"德勤亞太高成長500強"；順利完成股份制改造，進入創業板上市審批階段。
2011年，經中國證監會核準，翰宇藥業首次公開發行股票並在創業板上市，成為中國合成肽第壹股；榮獲 "2011廣東企業500強"；研發中心被國家發改委認定為 "國家地方聯合工程實驗室"。研發中心被國家發改委認定為 "國家地方聯合工程實驗室"。
2012年，公司入選 "2012福布斯中國最具潛力企業"。
2013年，公司入選 "2013福布斯中國最具潛力企業"。