其次是我國生物醫藥科研缺乏廣泛合作。我國生物醫藥的研發主要靠企業自身，而在發達國家生物醫藥科研是企業、研究院、高校等組成的壹個高效率團體。因此，單靠我國生物醫藥企業由於缺乏必要的信息交流與科技合作難免出現“閉門造車”的現象。而這樣還有壹個害處在於因為不能實行資源***享和集約化規模從而極易導致低水平重復研究和重復投資的浪費現象發生。
第三，我國生物醫藥科研成果的轉化率偏低。由於我國生物醫藥產業“小、散、亂”現象嚴重，企業對生物醫藥的研發受限於資金和人才，因此相比較於國外的生物醫藥研發，我國的生物醫藥研發更像是“小打小鬧”。更有甚者，壹些醫藥研發企業在藥品中加入壹些沒有任何作用的新成分美其名曰“新藥”，這種缺乏對科研負責任的態度都阻礙了我國生物醫藥產業的發展。
第四，我國缺乏適合生物醫藥產業化的機制。目前我國現行的生物醫藥機制不利於資金和資源的合理利用、不利於人才的培養和引進、不利於產品的開發和上市、不利於產值和利潤的提高，更不利於我國生物醫藥產業國際競爭力的提升。這五個“不利於”導致我國如今仍未形成生物醫藥產業化的良好運行機制，這是壹個不容忽視的瓶頸。
最後是我國生物醫藥產業化人才匱乏。這裏面有兩方面的制約因素，首先是生物醫藥專業化人才匱乏。由於生物醫藥研發涉及多學科領域的知識與技術，因此對於生物醫藥的專業化人才如藥學信息、生物工程人才極為不足；其次是管理人才，這些年來，去國外學習生物醫藥的高級人才回國後都選擇自主創業，因此壹些高素質的生物醫藥研發管理者、市場策劃戰略家更是少之又少，這也不利於生物醫藥產業的發展。