1，辦公廳。負責機關日常運行，承擔安全、保密、信訪、政務公開等工作。？
2.人事部。制定衛生專業人才發展政策，承擔機關和直屬單位人事管理、機構編制和隊伍建設，負責衛生專業技術人員資格管理。？
3.規劃發展與信息技術部。承擔健康中國戰略協調和推進工作，組織制定衛生事業發展中長期規劃，指導衛生服務體系和信息化建設，組織開展愛國衛生運動和衛生統計工作。帶頭執行《煙草控制框架公約》。？
4.財務部。承擔機關和預算管理單位的預決算、財務、資產管理和內部審計工作。？
5.法規司。組織起草法律法規、規章和標準草案，承擔規範性文件的合法性審查，承擔行政復議、行政訴訟等工作。？
6.體制改革司。承擔深化醫藥衛生體制改革的具體工作，研究提出深化醫藥衛生體制改革的重大方針、政策和措施建議，承擔組織推進公立醫院綜合改革工作。？
7.疾病控制中心。制定重大疾病防控規劃、國家免疫規劃、嚴重危害人民健康的公共衛生問題幹預措施並組織實施，完善疾病防控體系，承擔傳染病信息發布工作。？
8.醫療管理醫院管理局。制定醫療機構和醫務人員、醫療技術應用、醫療質量安全、醫療服務、采供血機構管理和行風建設等方面的管理政策、規範和標準，並監督實施，承擔促進護理康復事業發展的工作。制定公立醫院運行監管、績效評價和考核制度。？
9.初級衛生部門。擬訂基層衛生政策、標準和規範並組織實施，指導基層衛生服務體系建設和鄉村醫生相關管理工作。？
10，衛生應急辦公室(突發公共衛生事件應急指揮中心)。承擔衛生應急和緊急醫療救援工作，組織編制專項預案，承擔預案演練的組織、實施、指導和監督。指導衛生應急體系和能力建設。發布突發公共衛生事件應急處理信息。？
11，科技教育系。制定衛生科技發展規劃和相關政策並組織實施。承擔實驗室生物安全的監管工作。組織實施畢業後醫學教育和住院醫師、專科醫師培訓等繼續教育，協調指導醫學院校教育。？
綜合監督局。承擔公共衛生、醫療衛生監督，查處醫療服務市場違法行為。組織學校衛生、公共衛生、飲用水衛生和傳染病防治的監督檢查。完善綜合監管體系，引導和規範執法行為。？
13，藥物政策與基本藥物制度司。完善國家基本藥物制度，組織制定國家藥物政策和基本藥物目錄。開展用藥監測、臨床綜合評價和藥品短缺預警。對國家基本藥物目錄中的藥品價格政策和鼓勵、支持藥品生產的政策提出建議。？
14，食品安全標準與監測評價部。組織制定食品安全國家標準，開展食品安全風險監測、評估和溝通，承擔食品原料新品種、食品添加劑新品種和食品相關產品新品種的安全性審查。？
15，老齡健康科。組織制定並協調實施應對老齡化的政策措施。組織制定醫養結合的政策、標準和規範，建立健全老年健康服務體系。承擔全國老齡工作委員會的具體工作。？
16，婦幼保健科。制定婦幼衛生政策、標準和規範，推進婦幼衛生服務體系建設，指導婦幼保健、出生缺陷預防、嬰兒早期發育、人類輔助生殖技術管理和生殖技術服務。？
職業健康處。制定職業衛生和放射衛生相關政策和標準並組織實施。開展重點職業病監測、專項調查、職業健康風險評估和職業人群健康管理。協調職業病防治工作。？
18，人口監測與家庭發展部。承擔人口監測預警工作，提出人口與家庭發展相關政策建議，完善生育政策並組織實施，建立健全計劃生育特別救助制度。？
19，宣傳部。組織健康促進、健康教育和健康促進活動，承擔健康科學普及、新聞和信息發布工作。？
20.國際合作部(港澳臺辦公室)。組織和指導衛生工作領域的國際交流與合作、對外宣傳和對外援助，開展與港澳臺的交流與合作，承擔機關和直屬單位外事管理工作。？
21，衛生局。負責中央保健對象的醫療保健工作，中央部門有關幹部的醫療管理，黨和國家重要會議、活動的醫療衛生保障工作。？
國家衛生健康委員會-國家衛生健康委員會內設機構